Identifikasi isolat bakteri penghasil enzim selulase dari limbah ampas tebu berdasarkan analisis homologi gen penyandi 16s rna

Uji biokimia dan mikrobiologi saja tidak dapat digunakan untuk mengidentifikasi homologi suatu bakteri. Untuk itu isolat bakteri SF01 yang memiliki aktivitas selulolitik yang berasal dari limbah ampas tebu diidentifikasi berdasarkan analisis homologi gen penyandi 16S rRNA dengan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR). Dengan amplifikasi 16S rRNA, dapat diketahui hubungan kekerabatannya dengan bakteri selulolitik yang lain dilihat dari desain pohon filogenetik. Proses amplifikasi 16S rRNA dilakukan dengan menggunakan primer 9F dan 1541R. Urutan gen penyandi 16S rRNA dari isolat SF01 adalah 1452 bp melalui analisa dengan metode Neighbor-Joining Tree. Berdasarkan desain pohon filogenetiknya bakteri SF01 memiliki hubungan kekerabatan yang paling dekat dengan Bacillus subtilis strain B7 dengan homologi sebesar 99%