Identification of potato cyst nematodes using the polymerase chain reaction

On a utilisé la réaction d'amplification en chaîne par polymérase (PCR) pour amplifier une région entre l'ARNr 5S et la séquence de tête épissée de gènes d'ARN (5S-SL) de #Globodera rostochiensis$ et de #G. pallida$. On a pu distinguer les souches de #G. rostochiensis$, qui ont amplifié invariablement un seul fragment de 914 bp, des souches de #G. pallida$, qui ont amplifié des fragments de 914 bp et 853 bp, et aussi de la plupart des souches Pa1 de #G. pallida$, qui ont amplifié un seul fragment de 853 bp. L'identification des souches de #G. pallida$ et de #G. rostochiensis$ concordait bien lorsque l'on a utilisé soit la réaction PCR pour amplifier des fragments 5S-SL, soit des sondes d'ADN spécifiques aux nématodes à kystes de la pomme de terre, soit des tests sur plantes hôtes différentielles. La distinction entre les souches PA3 et PA1 de #G. pallida$ a été peu précise car certaines souches de Pa1 ont amplifié des fragments de 914 bp et de 853 bp, une réaction typique de Pa3, alors qu'elles s'hybridaient avec une sonde d'ADN spécifique de Pa1. D'ailleurs les tests de résistances ont montré qu'une de ces populations de nématodes pouvait être un mélange de Pa1 et de Pa3. Les expériences d'hybridation moléculaires ont indiqué que les sondes d'ADN utilisées n'étaient pas homologues aux séquences 5S-SL. (Résumé d'auteur