Specific probes efficiently distinguish root-knot nematode species using signature sequences in the ribosomal intergenic spacer

Ont été établies des sondes moléculaires - destinées à identifier les espèces de #Meloidogyne$ - grâce à des différences spécifiques dans l'espaceur intergénique (IGS) de l'ADN ribosomal. Les séquences de nucléotides de l'IGS ont été obtenues en séquençant l'ADN amplifiée par PCR. L'alignement des séquences de l'IGS de #M. chitwoodi$ et #M. fallax$ a révélé plusieurs régions contenant des différences localisées. Des amorces PCR ont été synthétisées qui ont donné des produits d'amplification spécifiques lorsqu'utilisées avec des produits d'amorce non spécifiques, ont pu être séparés par leur taille dans un gel d'agarose, procurant ainsi un test fiable et précis ne nécessitant pas de restriction enzymatique. L'amplification de l'ADN d'un nématode juvénile ou d'un oeuf par PCR multiplex a permis d'identifier #M. chitwoodi$ et #M. fallax$ et de les séparer de #M. hapla$, #M. javanica$, #M. arenaria$ et #M. mayaguensis$. (Résumé d'auteur