Segregación de polimorfismos en μ-calpaina y calpastatina en ganado para carne en Puerto Rico

The distribution of single nucleotide polymorphisms (SNP) in two regions of Calpain (CAPN1-316 and CAPN1-4751) and a SNP in Calpastatin (CAST) was determined in beef cattle raised in Puerto Rico (n=271). Genotypic and allelic frequencies were determined for each SNP in Senepol (n=53), Charolais (n=49), Angus (n=27), Charbray (n=38), Brahman (n=16), Zebu (n=16) and crossbred bulls (n=72). For CAPN1-ZAB, the global genotypic frequencies (n=219) were 0.07/CC (n=15), 0.38/CG (n=83) and 0.55/GG (n=121) with allelic frequencies of 0.21/C and 0.74/G. The CC genotype was absent in Charbray, Charoláis, Angus, Zebu and Brahman bulls. In Charolais, Zebu, Brahman and Charbray the GG genotype was in greater proportion than CG, while the inverse was observed in the Senepol breed. In Angus and crossbred animals, the CG and GG genotype were found in equal distribution. The global genotypic frequencies for CAPN1-4751 (n=256) were 0.17/CC (n=44), 0.45/CT (n=114) and 0.38/TT (n=98). The allelic frequencies were 0.39/C and 0.61/T. Animals inheriting the CT genotype were more frequent in Charolais, Senepol, Angus and crossbred bulls, while the TT was more common in Charbray and Brahman. For CAST, the global genotypic frequencies (n=261) were 0.04/CC (n=10), 0.26/CT (n=68), and 0.70/TT (n=183), respectively. The global allelic frequencies were 0.17/C and 0.83/T. The CC genotype was not found in Charoláis, Angus and Brahman breeds. The TT animals were more frequent in all breeds, as well as in the crossbred population. The segregation of polymorphisms in CAPN1 and CAST could potentially be associated with differences in economically important traits for Puerto Rican beef cattle, but this possibility should be evaluated by genotyping a broad range of animals with detailed phenotypic data before incorporating these SNP into markerassisted selection programs.Se determinó la distribución de polimorfismos de nucleótidos simples (SNP, por sus siglas en inglés) en dos regiones de calpaína (CAPN1- 316 y CAPN1-4751) y una en calpastatina (CAST) en ganado para carne criado en Puerto Rico (n=271). Las frecuencias genotípicas y alélicas se determinaron para cada SNP en las razas Senepol (n=53), Charolais (n=49), Angus (n=27), Charbray (n=38), Brahman (n=16), Cebú (n=16) y toros cruzados (n=72). Para CAPN1-316, las frecuencias genotípicas globales (n=219) fueron 0.07/CC (n=15), 0.38/CG (n=83) y 0.55/GG (n=121) con frecuencias alélicas de 0.26/C y 0.74/G. El genotipo CC estuvo ausente en las razas Charbray, Charolais, Angus, Cebú y Brahman. En toros Charolais, Cebú, Brahman y Charbray el genotipo GG fue mayor que el CG mientras lo inverso fue observado en toros Senepol. En animales Angus y en los cruces, los genotipos CG y GG se encontraron equitativamente distribuidos. Las frecuencias genotípicas globales (n=256) para CAPN1-4751 fueron 0.17/CC (n=44), 0.45/CT (n=114) y 0.38/ TT (n=98). Las frecuencias alélicas fueron 0.39/C y 0.61/T. Animales con el genotipo CT fueron más frecuentes en Charolais, Senepol, Angus y cruces. Los animales TT fueron más comunes en razas Charbray y Brahman. Para CAST, las frecuencias genotípicas globales (n=261) fueron 0.04/CC (n=10), 0.26/CT (n=68), y 0.70/TT (n=183), respectivamente, con frecuencias alélicas de 0.17/C y 0.83/T. No se encontraron animales de genotipo CC en Charolais, Angus y Brahman. El genotipo TT estuvo en mayor proporción en todas las razas y en los animales cruzados. La segregación de polimorfismos en CAPN1 y CAST puede estar implicada en diferencias en características de importancia económica en bovinos para carne criados en Puerto Rico, esta posibilidad debe ser evaluada mediante la genotipificación de un número grande de animales con registros de producción, previo a la incorporación de estos marcadores moleculares en programas de selección genética