Estimación de las frecuencias alélicas y genotípicas de los genes CAPN1 Y CAST asociados a la calidad de la carne en bovinos de la Cuenca del Papaloapan

Abstract The dual-purpose cattle are that used to produce meat and milk, is usually the product of miscegenation Cebu origin x European and / or creole. This genetic group has adapted to the climatic conditions of temperature, humidity, low quality pastures and any kind of parasite prevalent in tropical regions. In this work, a molecular thorough examination was performed to observe the frequency of two polymorphisms gene μ-calpain (CAPN1-316, CAPN1-530) and one gene calpastatin (CAST), associated with the softness of meat cattle dual purpose of the Cuenca Papaloapan. The tests were based on polymerase chain reaction (PCR) and length polymorphisms Restriction Fragment (LPRF) with restriction enzymes Btg I, Ava II and Rsa I for CG, AG and CG alleles, respectively (n = 331). To CAPN1-316 the genotypic frequencies obtained were 0.03 (AA), 0.86 (GG) and 0.11 (GA) and allele frequencies were 0.86 (G) and 0.14 (A). CAPN1-530 marker for the genotype frequencies were 0.02 (CC), 0.85 (GG) and 0.13 (GC) with an allele frequency of 0.85 to 0.15 for G and C. The genotype frequencies for the marker CAST were 0.32 (CC), 0.28 (GG) and 0.4 (GC) with an allele frequency of 0.68 for the G and 0.32 allele for allele C. The study population was found in Hardy Weinberg and values ​​χ2P two degrees of liberty were 0.964, 0.985 and 0.9803 for CAPN1-316, CAPN1-530 and CAST, respectively. According to the percentage of genotyping markers on capn1 and CAST genes it concludes that the analyzed population has low levels of markers for softness or tenderness of the meat, probably by cross undirected carried out regularly, thus it aims to improve the quality of meat based on genetic programs improved using genetically superior animals resulting from this study.Resumen El ganado de doble propósito es aquel utilizado para producir carne y leche. Generalmente es el producto del cruce de razas de origen Cebú x europeas y/o Criollo. Este grupo genético se ha adaptado a las condiciones climáticas de temperatura, humedad, baja calidad de pastos y clases de parásitos que prevalecen en las regiones tropicales. En este trabajo, se realizó un escrutinio molecular para observar la frecuencia de dos polimorfismos del gen de la μ-calpaína (CAPN1-316, CAPN1-530) y uno del gen de la calpastatina (CAST), asociados a la suavidad de la carne en ganado bovino de doble propósito de la Cuenca del Papaloapan. Las pruebas se basaron en Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) y Polimorfismos de la Longitud de Fragmentos de Restricción (RFLPs) con las enzimas de restricción Btg I, Ava II y Rsa I para los alelos C-G, A-G y C-G, respectivamente (n=331). Para CAPN1-316 las frecuencias genotípicas obtenidas fueron de 0.03 (AA), 0.86 (GG) y 0.11 (GA) y las frecuencias alélicas fueron 0.86 (G) y 0.14 (A). Para el marcador CAPN1-530 las frecuencias genotípicas fueron de 0.02 (CC), 0.85 (GG) y 0.13 (GC), con una frecuencia alélica de 0.85 para G y 0.15 para C. Las frecuencias genotípicas para el marcador CAST fueron de 0.32 (CC), 0.28 (GG) y 0.4 (GC), con una frecuencia alélica de 0.68 para el alelo G y 0.32 para el alelo C. La población en estudio no se encontró en equilibrio Hardy Weinberg y los valores de χ2P con dos grados de libertad fueron de 0.964, 0.985 y 0.9803 para CAPN1-316, CAPN1-530 y CAST, respectivamente. De acuerdo con el porcentaje de la genotipificación de los marcadores en los genes CAPN1 y CAST se concluye que la población analizada tiene bajos índices de marcadores para la suavidad o terneza de la carne, probablemente por las cruzas no dirigidas que se realizan habitualmente, de esta forma se propone, mejorar la calidad de la carne en base a programas de mejoramiento genético dirigido utilizando los animales genéticamente superiores resultantes de este estudio