Identification of Malassezia pachydermatis species by molecular biology methods

Druh Malassezia pachydermatis je lipofilní, nikoliv však lipid-dependentní kvasinka lahvovitého tvaru z oddělení Basidiomycota. Je běžně nalezana jako součást komenzální kožní mikroflory zdravých teplokrevných obratlovců. Za vhodných podmínek se ale může projevit jako oportunní patogen. M. pachydermatis je nejčastější fungální izolát asociovaný s rozvojem zánětlivého onemocnění zevního zvukovodu psů (lat. otitis externa). Otitis externa je onemocnění s multifaktoriální etiologií, na jehož rozvoji se podílí, kromě patologicky zvýšeného množství bakterií a kvasinek ve zvukovodu, také řada dalších primárních, predispozičních a udržujících faktorů. Práce je zaměřena na popis druhu M. pachydermatis a celého rodu Malassezia z hlediska taxonomie, morfologických a fyziologických vlastností. Dále se zabývá etiologií otitis externa, klinickými příznaky a druhy mikroorganizmů podílejících se na vzniku tohoto onemocnění. Molekulárně biologická detekce druhu Malassezia pachydermatis byla provedena metodou polymerázové řetězové reakce (PCR) ve vzorcích získaných výtěrem zevního zvukovodu psů a koček. Z celkového počtu 114 vzorků bylo určeno jako druh M. pachydermatis 96 (84 %) vzorků a z celkového počtu 18 (16 %) negativních vzorků bylo 13 dourčeno doplňkovou kultivací.Malassezia pachydermatis is lipophilic, but not lipodependent yeast with a bottle shape, belonging to the phylum Basidiomycota. It is commonly found as commensal element of cutaneous microflora healthy warm-blooded vertebrates. It can become opportunistic pathogen under appropriate conditions. M. pachydermatis is the most common fungal isolate associated with the development of inflammatory diseases of external ear canal of dogs. Otitis externa is a disease with multifactorial etiology. In addition, pathologically increased amount of bacteria and yeast in the ear canal to the disease involved a number of other primary, predisposing and maintaining factors. The aim of my thesis is focused to the description, taxonomy, morpfological and pfysiological characteristics of genus Malassezia and especially of M. pachydermatis species. It also occupied by otitis externa etiology, clinical symptoms and types of microorganisms, involved in the emergence of this disease. Molecular biological detection of Malassezia pachydermatis was performed using polymerase chain reaction (PCR) in samples obtained from swabs from external auditory duct of dogs and cats. From the total number of 114 samples were 96 (84%) identified by PCR metod as M. pachydermatis. The rest of samples were negative and 13 of them were identified by cultivation as another types of microorganisms.Katedra biologických a biochemických vědDokončená práce s úspěšnou obhajobo