Analyse de la distribution des crossing-overs sur le chromosome 3B du blé tendre (Triticum aestivum) et des facteurs influençant cette distribution

Crossovers (CO) are necessary in breeding to introgress regions of interest in agronomic varieties from cultivated species such as bread wheat (Triticum aestivum L.). In order to evaluate the impact of factors influencing CO formation, we started the characterisation of their distribution on the largest wheat chromosome (chromosome 3B, 995 Mb) using the recently developed physical map as well as some sequenced regions of few megabases. Comparison between a dense genetic map (102 markers) and a physical deletion map shows that 77 % of CO are present in the distal regions covering 25 % of the chromosome. Comparison between different genetic maps indicates that this distribution is conserved despite local differences of CO ratio between different populations and between male and female meiosis. Positive interference impacts significantly CO distribution at distances less than 10 cM on chromosome 3B. However, factors involved in the inhibition of CO formation in the proximal regions remain unknown. Positioning proximal regions in distal region of the chromosome increase only weakly the frequency of CO, suggesting that the low frequency observed in the proximal regions is not due to their proximal position. Moreover, sequence divergence between the two homologous chromosomes is not involved in the low frequency observed in the proximal regions since homozygous regions do not exhibit more CO than heterozygous ones. On the contrary, analyses at the level of a 3.1 Mb sequenced region show that high CO frequencies correlate well with gene occurrence. Low CO frequency observed in the proximal regions could thus be explained by a low gene density.Les crossing-overs (CO) sont indispensables dans la création variétale pour permettre l'introgression de régions d'intérêt dans les variétés agronomiques d'espèces cultivées telles que le blé tendre (Triticum aesstivum L.). Afin d'évaluer l'impact des facteurs qui influencent leur formation, nous avons entrepris une caractérisation fine de leur distribution sur le plus grand chromosome ( chromosome 3B, 995Mb) du blé tendre en s'appuyant sur la carte physique récemment développée et le séquençage de quelques régions de plusieurs mégabases. La comparaison entre une carte génétique dense (102 marqueurs) et une carte physique de délétion montre que 77% des CO sont présents dans les régions distales couvrant seuleument 25% du chromosome. La comparaison de différentes cartes génétiques montre de plus que cette distribution est conservée entre populations avec cependant des différences de taux de CO locaux entre populations mais également entre méiose mâle et femelle. Cette distribution est influencée par une interférence positive forte à des distances inférieures à 10 cM. Cependant, les faibles fréquences de CO observées au sein des régions proximales restent inexpliquées. En effet, la faible augmentation du taux de CO observée au sein des régions proximales placées en position distale suggère que la position proximale de ces régions sur le chromosome ne semble pas responsable de leur faible fréquence de CO. De plus, nous avons montré que ces faibles fréquences ne seraient pas non plus dues à une divergence de séquence entre chromosomes homologues au sein des régions proximales, la fréquence de CO étant toujours aussi faible au sein de celles-ci entre deux chromosomes homozygotes. En revanche, l'analyse à l'échelle d'une région séquencée de 3.1 Mb indique que les fréquences de CO importantes sont fortement corrélées avec la présence de gènes. L'inhibition de la formation des CO au sein des régions proximales pourrait ainsi s'expliquer par la présence de gènes en quantité moins importante dans ces régions comparées aux régions distales