Study of Lithuania cormorants using DNA techniques

Lietuvoje didysis kormoranas (Phalacrocorax carbo) yra laikoma viena iš invazinių paukščių rūšių, kuriai kasmet atliekamas monitoringas bei taikomos populiacijos reguliavimo priemonės. Darbe panaudojant mikrosatelitinių žymenų ir mitochondrinio genomo D kilpos regiono metodus buvo įvertinta Lietuvoje aptinkamų kormoranų genetinė įvairovė. Nusekvenavus 13-os paukščių MtDNR 310 bp ilgio (bendras regiono ilgis be trūkių 309 bp) regioną aptikti 8 haplotipai. Rasta monomorfinių vietų 301, o polimorfinių – 8. Iš jų ,,Singleton“ variabilių vietų 5 (pozicijose: 10, 124, 150, 235, 307), o ,,Parsimony“ informatyvių vietų 3 (pozicijose: 216, 267, 297). Haplotipų (genų) įvairovė yra 0,91.The great cormorant (Phalacrocorax carbo) is considered as one of the invasive species in Lithuania, and is conducted annually for population monitoring and control measures. The present study evaluated genetic diversity of cormorants found in Lithuania by using microsatellite markers and mitochondrial D-loop region of genomic approaches. Sequencing 310 bp (total number of sites excluding sites with gaps / missing data: 309 bp) the mtDNA region of 13 birds revealed 8 haplotypes. Sequence comparison showed 301 invariable (monomorphic) sites and 8 variable (polymorphic) ones. There was also found 5 singleton variable sites (positions: 10, 124, 150, 235, 307) and 3 parsimony informative sites (positions: 216, 267, 297). Haplotype (gene) diversity size is 0,91.Vytauto Didžiojo universiteta