Comparative genomics and transcriptomics uncovers chromosomal recombination and small RNA diversity in the penicillin producing fungus \(\textit {Pencillium chrysogenum}\)

Das bipolare heterothallische Fortpflanzungssystem des filamentösen Ascomyzeten und Penicillin-Produzenten \(\textit {Penicillium chrysogenum}\) ermöglicht es sexuelle Nachkommen zu generieren. Zum Nachweis von Rekombinationsereignissen, zwischen der DNA beider Kreuzungspartner, wurden die Genome der Parentalstämme und Nachkommen sequenziert. Mit Hilfe vergleichender Genomanalysen konnten genomweite Rekombinationen als Folge der sexuellen Fortpflanzung nachgewiesen werden. In einem zweiten Ansatz konnten, durch Sequenzierungen kleiner RNAs, erstmals Dicer-abhängige kleine RNAs endogener Herkunft in \(\textit {P. chrysogenum}\) nachgewiesen werden. Es konnten endogene \(\textit{small interfering}\) RNAs (siRNAs) und microRNA-ähnliche RNAs (milRNAs) identifiziert werden, die an einem post-transkriptionellen Mechanismus zur Genstilllegung beteiligt sind. Kreuzungen und regulatorisch wirksame kleine RNAs können als Werkzeug zur Manipulation von \(\textit {P. chrysogenum}\) und zur Optimierung industrieller Produktionsstämme verwendet werden