IDENTIFIKASI MOLEKULER POHON DI HUTAN RAWA GAMBUT TRIPA MENGGUNAKAN GEN NUKLEUS

Hutan Rawa Gambut Tripa merupakan kawasan lindung yang memilikibiodiversitas yang tinggi, namun di beberapa lokasi terjadi kerusakan akibat alihfungsi lahan sehingga perlu adanya upaya perbaikan. Langkah awal yang perludilakukan adalah melakukan eksplorasi dan identifikasi jenis-jenis pohon yangada di kawasan ini. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan mendugahubungan filogenetik antar spesies pohon yang hidup di Hutan Rawa GambutTripa dengan penanda gen nukleus (ITS 1, 5.8S rRNA, dan ITS 2). Penelitiandilaksanakan di tiga laboratorium yaitu Laboratorium Biologi Sel dan MolekulerFMIPA Universitas Syiah Kuala, Laboratorium Genetika dan BioteknologiMolekuler, Sekolah Ilmu dan Teknologi Hayati (SITH), ITB, dan LaboratoriumGenetika Hutan dan Kehutanan Molekuler, Fakultas Kehutanan, IPB dari bulanJuni 2015 sampai dengan Desember 2016. Metode penelitian dilakukan denganeksperimental laboratory yang terdiri atas ekstraksi DNA, PCR, dansekuensing pada 25 spesies pohon. Analisis data menggunakan programBioEdit, Clustal X, Mega 6 dan BLAST. Hasil identifikasi morfologimenunjukkan bahwa terdapat 25 jenis pohon yang hidup di Hutan Rawa GambutTripa. Hasil PCR menunjukkan bahwa primer ITS 1 dan ITS 4 berhasilmengamplifikasi 24 spesies pohon. Hasil analisis BLAST menunjukkan adanya 6spesies yang memiliki kemiripan urutan basa dengan sekuen yang tersimpan diGeneBank DNA Database yaitu Branckenridgea palustris, Gonystylus sp.,Macaranga triloba, Syzygium garciniifolium, Syzygium sp. 1, dan Tristaniopsiswhiteana. Rekonstruksi pohon filogeni dengan Metode Neighbor-Joining (NJ)bootstrap 1000X menunjukkan bahwa multilocus (ITS 1, 5.8S rRNA, dan ITS 2)berhasil menjadi penanda bagi familia Myrtaceae dan Apocynaceae