Specifie probes efficiently distinguish root-knot nematode species using signature sequences in the ribosomal intergenic spacer

Summary- Molecular probes were designed to identify Meloidogyne species by hybridizing to unique signature sequences located within variable regions of the ribosomal intergenic spacer (IGS). IGS nucleotide sequences were obtained by sequen-cing the corresponding PCR-amplified DNA. Sequence alignments of the IGS from M. chùwoodi and M. fallax revealed several areas of localized dissimilarity to which species-specific PCR primers were synthesized. When used in combination with non-specifie (conserved) primers, these primer pairs produced species-specific PCR amplification products as revealed by agarose gel electrophoresis. Size separation of amplified products from a single PCR reaction utilizing a combination of five specifie and non-specifie primers was demonstrated to provide an accurate, single-test assay, without the need for restriction digests. Multiplex-PCR amplification of DNA from single juveniles or a small number of eggs efficiently distinguished M. chitwoodi and M. fallax from M. hapla, M. incognira, M. javanica, M. arenaria, and M. mayaguensis. Résumé- Sondes spécifiques permettant de distinguer les espèces de Meloidogyne en utilisant des signatures séquentielles de l'espaceur intergénique ribosornal- Ont été établies des sondes moléculaires-destinées à identifier les espéces de Meloidogyne- grâce à des différences spécifiques dans l'espaceur intergénique (IGS) de l'ADN ribosomal. Les séquences de nucléotides de l'IGS ont été obtenues en séquençant l'ADN amplifié par PCR. L'alignement des séquences de l'IGS de M. chilwoodi et M. failax a révélé plusieurs régions contenant des différences localisées. Des amorces PCR Ont été synthétisées qui ont donné des produits d'amplification spécifiques lorsqu'utilisées avec des amorces non spécifiques (conser