Molecular Identification of Microorganisms Associated to the Rhizosphere of Vanilla Plants in Colombia

<p class="MsoNormal" style="line-height: 200%; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-margin-top-alt: auto; mso-margin-bottom-alt: auto;"><span style="line-height: 20px;">The cultivation of vanilla (Vanilla planifolia) is highly promising in Colombia, but more research is needed on its agronomical </span><span style="line-height: 20px;">management and beneficial microorganisms that grow associated to its rhizosphere, on which the plant depends for its </span><span style="line-height: 20px;">nutrition and growth. This study involved the identification of microorganisms associated to the rhizosphere of vanilla plants </span><span style="line-height: 20px;">in a crop located in Sopetrán, Colombia. The microbes were isolated in selective media for functional groups such as cellulolytic, </span><span style="line-height: 20px;">proteolytic, inorganic and organic phosphate (phytate) solubilizers, and asymbiotic nitrogen fixing bacteria. After isolation </span><span style="line-height: 20px;">and purification, 109 microbial isolates were obtained. DNA was extracted from 52 selected isolates for molecular identification </span><span style="line-height: 20px;">based on ITS and 16S rDNA sequencing, for fungi and bacteria, respectively. The diversity of rhizosphere microorganisms</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: 200%; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-margin-top-alt: auto; mso-margin-bottom-alt: auto;"><span style="line-height: 20px;">found was significant. Bacteria such as <em>Bacillus megaterium</em>, <em>Pseudomonas koreensis</em> and <em>Acinetobacte</em>r sp., and the fungus<em> </em></span><span style="line-height: 20px;"><em>Plectosphaerella </em>sp., may have a high potential to be used as biofertilizers to improve vanilla plant nutrition and growth.</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: 200%; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-margin-top-alt: auto; mso-margin-bottom-alt: auto;"><span style="line-height: 20px;"><br /></span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: 200%; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-margin-top-alt: auto; mso-margin-bottom-alt: auto;"><span style="line-height: 20px;">IDENTIFICACIÓN MOLECULAR DE MICROORGANISMOS ASOCIADOS A LA RIZOSFERA DE PLANTAS DE VAINILLA EN COLOMBIA</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: 200%; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-margin-top-alt: auto; mso-margin-bottom-alt: auto;"><span style="line-height: 20px;"><br /></span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: 200%; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-margin-top-alt: auto; mso-margin-bottom-alt: auto;"><span style="font-family: 'Times New Roman'; font-size: xx-small;"><span style="line-height: 20px;">El cultivo de vainilla es altamente promisorio en Colombia, pero se requiere mayor conocimiento de su manejo agronómico </span></span><span style="line-height: 20px; font-family: 'Times New Roman'; font-size: x-small;">y de los microorganismos que crecen asociados a su rizosfera, de los cuales depende esta planta para su nutrición y crecimiento. </span><span style="line-height: 20px; font-family: 'Times New Roman'; font-size: x-small;">En este trabajo se realizaron aislamientos de microorganismos de la rizosfera de plantas de vainilla en un cultivo piloto ubicado </span><span style="line-height: 20px; font-family: 'Times New Roman'; font-size: x-small;">en el municipio de Sopetrán (Antioquia, Colombia). Los microorganismos se aislaron en medios selectivos de crecimiento </span><span style="line-height: 20px; font-family: 'Times New Roman'; font-size: x-small;">para evaluar su capacidad para descomponer celulosa, proteínas, solubilizar fosfato inorgánico y orgánico (fitato) y fijar </span><span style="line-height: 20px; font-family: 'Times New Roman'; font-size: x-small;">nitrógeno en forma asimbiótica. Una vez aislados y purificados, se obtuvieron un total de 109 aislamientos, de los cuales se </span><span style="line-height: 20px; font-family: 'Times New Roman'; font-size: x-small;">seleccionaron 52 morfotipos para su identificación molecular por secuenciación de las regiones ITS y 16S del ADN ribosomal</span></p><p class="MsoNormal" style="line-height: 200%; margin: 0cm 0cm 0pt; mso-margin-top-alt: auto; mso-margin-bottom-alt: auto;"><span style="font-family: 'Times New Roman'; font-size: xx-small;"><span style="line-height: 20px;">para hongos y bacterias, respectivamente. Se encontró una alta variedad de microorganismos en la rizosfera de plantas de </span></span><span style="line-height: 20px; font-family: 'Times New Roman'; font-size: x-small;">vainilla, destacándose las bacterias <em>Bacillus megaterium, Pseudomonas koreensis</em> y <em>Acinetobacter</em> sp. y el hongo <em>Plectosphaerella</em> sp., </span><span style="line-height: 20px; font-family: 'Times New Roman'; font-size: x-small;">por su potencial para ser utilizados como biofertilizantes destinados a mejorar la nutrición y el crecimiento de estas plantas.</span>