Recombinant congenic strains - tools for biomedical science

Tato práce se věnuje použití myších rekombinantních kongenních kmenů CcS/Dem v genetice komplexních znaků. Zaměřila jsem se na použití těchto kmenů při studiu genetické vnímavosti vůči intracelulárnímu parazitu Leishmania major. Určení genů ovlivňujících vnímavost nebo rezistenci umožní lepší porozumění mechanismům nejen tohoto onemocnění, ale i dalších komplexních polygenních chorob, jako jsou například nádorová onemocnění či civilizační choroby. Pomocí těchto rekombinantních kongenních kmenů, odvozených ze susceptibilního kmene BALB/cHeA a rezistentního kmene STS/A, lze zkoumat jednotlivé podmiňující geny samostatně, protože každý z dvaceti CcS/Dem kmenů nese náhodnou část (12.5%) genů kmene STS/A na pozadí kmene BALB/cHeA (87.5%). Srovnáním výsledků genotypizace s fenotypem (patologické a imunologické reakce) se posoudí možná existence kandidátního lokusu, který ovlivňuje vnímavost vůči onemocnění. Hlavním výsledkem této diplomové práce je mapování segmentů původu STS v jednotlivých CcS/Dem kmenech, čímž se zvyšuje znalost jejich struktury, a tím i síla CcS/Dem kmenů jakožto nástroje pro mapování lokusů kvantitativních znaků. Dále jsem se podílela na tvorbě rekombinantů CcS/Dem kmenů pro potřeby vazebné analýzy.The topic of this diploma thesis is application recombinant congenic strains of mice of CcS/Dem series for mapping of complex traits. I focused on use of these strains for study of genetic susceptibility to intracellular parasite Leishmania major. Determination of genes modifying susceptibility or resistance enables better understanding of mechanisms of not only this disease, but also another complex polygenic disease, for example cancer. Using these recombinant congenic strains, developed from susceptible strain BALB/cHeA and resistant strain STS/A, is possible to examine the modifying genes alone, because all of twenty CcS/Dem strains carries random part (12.5%) of genes of STS/A strain on the background of BALB/cHeA strain (87.5%). Comparing the results of genotypization with phenotype (patological and imunnological reactions) it is possible to determine candidate loci of susceptibility modifying genes. Main output of this diploma thesis was mapping of areas of STS origin in CcS/Dem strains, which leads to better understanding their structure and to improve the CcS/Dem strains as a tool for analyzing QTLs. I also took part in preparation of CcS/Dem recombinants, which are used for linkage analysis