Géographie de zoonoses en Thaïlande : de la distribution des rongeurs, vecteurs et hôtes, au risque de transmission

Formerly considered in Thailand as wild meat or agricultural pests, rats and mice (Murinae) have recently emerged as major carriers and reservoirs of diseases since leptospirosis epidemics dramatically increased in 1996. Furthermore rodents are responsible for transmitting scrub typhus, another zoonosis with high incidence, and represent additional threat by carrying hantaviruses, which remain undiagnosed. This thesis aims at exploring the geography of rodent-borne zoonoses in order to assess the risk of human infection.A long-term fieldwork allowed studying the diversity of murine rodents in different representative ecosystems. A survey in Phrae province was conducted to evaluate the health system and health behaviour in rural areas. A database was set up and analysed within a dedicated Geographic Information System “Rodents and Health” applied to the whole country.This research allowed updating the description of the main murine rodents in Thailand, drawing their distribution by using remote sensing tools and field observations, and assessing their contribution in the transmission of pathogens to humans. The geography of these zoonoses reflects disparities in living conditions: linked to a limited use and restricted access to health services and, above all, to rodents hunting and cooking activities, the exposure to rodent-borne zoonoses expresses the poverty.This thesis proposes a critical approach of the tools and methods in spatial analysis for studying vector-borne diseases.Longtemps considérés en Thaïlande comme simple gibier mais souvent destructeurs des cultures, les rats et les souris (Murinae) se sont révélés d'importants vecteurs de germes pathogènes pour l'Homme, depuis l'émergence soudaine de la leptospirose en 1996. Ils sont aussi responsables de la transmission du typhus des broussailles et probablement d'hantaviroses dont l'incidence reste suspectée. Cette thèse a pour objectif d'analyser la géographie de ces zoonoses afin d'en mesurer le risque de transmission à l'Homme.Un important travail de terrain a permis de collecter et d'étudier les rongeurs murins dans différents milieux représentatifs de leur diversité. Parallèlement, une enquête conduite dans la province de Phrae a montré la variabilité du système de soins et des comportements de santé. Un Système d'Information Géographique « Rongeurs et santé » centralise l'intégralité des données sur l'ensemble du territoire pour une analyse spatio-temporelle.Cette recherche a permis de mettre à jour la description et la distribution par télédétection des principaux rongeurs murins thaïlandais ainsi que leur implication dans la transmission de germes pathogènes. La géographie de ces zoonoses reflète des différences de niveau de vie : l'exposition de l'Homme à ces maladies résulte de la chasse et de la consommation de rongeurs mais aussi d'un accès et d'un recours aux soins limités, traduisant ainsi la pauvreté des populations touchées.Ce travail offre une approche critique des méthodes alliant les outils de la géomatique, l'analyse spatiale et la télédétection, pour l'étude des zoonoses