OPTIMASI PCR : KONSENTRASI PRIMER DAN VOLUME TEMPLAT DNA PADA AMPLIFIKASI mtDNA IKAN MEDAKA Oryzias spp. DI DAERAH ALIRAN SUNGAI (DAS) MAROS

Keberhasilan suatu PCR dipengaruhi oleh beberapa faktor. Dalam pelaksanaan PCR diperlukan komponen-komponen seperti templat DNA dan primer. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui parameter yang utama dalam mempengaruhi kualitas produk PCR dan kondisi optimal dalam pelaksanaan PCR. Optimalisasi yang pertama yaitu volume templat DNA dilakukan dengan menguji sampel-sampel dengan volume DNA template yang berbeda yaitu 0.5 ??l dan 1 ??l. Optimalisasi yang kedua yaitu konsentrasi primer 12s rRNA dan 16srRNA dilakukan dengan menguji sampel-sampel dengan konsentrasi primer yang berbeda yaitu 1 ??M dan 10 ??M. Hasil analisis menunjukkan bahwa volume DNA sebanyak 1 ??l dan konsentrasi primer 1 ??M mampu menghasilkan amplifikasi DNA yang optimal