Le mélange dans les populations humaines: modèles et méthodes d'estimation

Tout au long de l'histoire, les populations humaines se sont déplacées et ont échangé leurs allèles, donnant naissance à des populations mélangées. Ces dernières possèdent des caractéristiques génétiques qui dépendent des apports génétiques des populations parentales. Depuis les premiers travaux de Bernstein, de très nombreux estimateurs de ces contributions (taux ou coefficients de mélange) ont été proposés. Les méthodes d'estimation peuvent être simples, corrélant selon une combinaison linéaire les fréquences alléliques observées dans les populations parentales à celles observées dans la population mélangée. Elles peuvent aussi être plus complexes, proposant l'estimation par des approches bayésiennes ou de maximum de vraisemblance. Certaines de ces méthodes sont encore actuellement très utilisées car elles présentent un intérêt au niveau des paramètres pris en compte, ou car elles ont prouvé leur fiabilité. D'autres ont été abandonnées ou oubliées, malgré des avantages intéressants et une fiabilité notable pour certaines. Nous proposons ici une revue d'une quarantaine de méthodes d'estimation des taux de mélange et une réflexion sur leur utilisation