Synthèse asymétrique, et confirmation de structure, de la stigmatelline et de la crocacine C

La stigmatelline et la crocacine C sont deux molécules isolées de cultures de myxobactéries. Elles présentent toutes les deux la propriété d’inhiber le processus de transfert d’électrons au niveau du complexe bc1 des cytochromes de cellules eucaryotes. Ces composés ont déjà été synthétisées. Cependant, aucune analyse RX de ces deux molécules ou d’intermédiaires clés de leur synthèse n’avaient jusqu’alors été réalisées. Ce mémoire décrit les synthèses totales de la stigmatelline et de la crocacine C au départ d’un intermédiaire commun dont la configuration absolue a été établie de façon indiscutable, notamment par une analyse RX. Ces deux synthèses partent du (2R,3s,4S)-2,4-diméthyl-4-hydroxy-1,5-pentanediol. Ce triol méso, facilement préparé selon la littérature par bis-hydroboration de l’alcool issu de la condensation du bromure de 2-propénylmagnésium avec la méthacroléïne et oxydation à l’eau oxygénée donne par traitement à l’acétate de vinyle dans le THF en présence de lipase PS le monoacétate de configuration 2R,3S,4S correspondant (e. e. 98,6%). L’échange du groupe OH primaire de ce monoacétate par un groupe phénylthio suivi d’une O-méthylation de l’OH secondaire puis d’une hydrolyse de la fonction acétate donne le (2R,3R,4R)-3-méthoxy-2,4- diméthyl-5-(phénylthio)pentan-1-ol; la configuration absolue de ce sulfure a été établie en le traitant pas le nickel de Raney dans l’éthanol pour donner le (2R,3S)-2,4-diméthyl-1,3-pentanediol, de configuration absolue connue. L’oxydation de cet hydroxysulfure par le réactif de Swern suivie de la condensation de l’aldéhyde formé avec le dérivé lithié du phénylacétylène a fourni un mélange de deux alcools diastéréomères, lesquels ont été oxydés par l’acide méta-chloroperbenzoïque en sulfones correspondantes. Ces deux sulfones ont été séparées par chromatographie. Par chance, l’une de ces deux sulfones a cristallisé et son analyse RX a montré qu’il s’agissait du (3R,4R,5R,6R)-5-méthoxy-4,6-diméthyl-1-phényl-7- (phénylsulfonyl)hept-1-yn-3-ol. De façon intéressante, la sulfone diastéréomère a été efficacement convertie en cette sulfone par réaction de Mitsunobu avec l’acide benzoïque suivie d’une hydrolyse du benzoate formé. Cette hydroxysulfone acétylénique comporte le même fragment polypropionique que la stigmatelline et la crocacine C. Sa transformation en l’une et l’autre de ces deux molécules a été réalisée par une suite d’étapes simples n’affectant pas ses centres stéréogéniques. Dans chaque cas, le produit obtenu a présenté des propriétés analytiques - RMN 1H et 13C, pouvoir rotatoire, point de fusion (dans le cas de la stigmatelline) – identiques à celles décrites dans la littérature. Ce travail établit donc de façon indiscutable leur structure: les molécules de stigmatelline et de crocacine C possèdent le même résidu polypropionique