Evaluación de la actividad anti batrachochytrium dendrobatidis por parte de la microbiota presente en la piel de dos especies de ranas andinas

La quitridiomicosis es una de las causas de la extinción masiva de los anfibios a nivel mundial. Pese a la letalidad que ha mostrado esta enfermedad, existen poblaciones de anuros que cohabitan con el hongo que la causa (Batrachochytrium dendrobatidis), sin presentar disminuciones poblacionales. Se cree que la microbiota presente en la piel de estas poblaciones puede presentar un efecto inhibitorio sobre Batrachochytrium dendrobatidis, lo cual explicaría por qué algunos grupos persisten a pesar de la presencia del patógeno. El objetivo de esta investigación fue determinar la actividad anti-Batrachochytrium dendrobatidis de la microbiota cultivable presente en la epidermis de Dendrosophus labialis y Rheobates palmatus, especies que co-ocurren con el hongo en una charca en el municipio de Ubaque, Cundinamarca (Colombia). Para recuperar una mayor diversidad de microorganismos se usaron dos medios de cultivo. Posteriormente, se evaluó la actividad antagónica de las especies aisladas a través de microensayos en placas de Elisa. En total se obtuvieron 615 morfotipos que fueron clasificados mediante MALDITOF y el gen ARNr 16S en 93 especies pertenecientes a 35 géneros, dentro de las que predominan especies pertenecientes a los géneros Pseudomonas, Bacillus, Chryseobacterium, y Arthrobacter. Se calcularon los índices de Shannon y Simpson que indicaron una alta diversidad de especies bacterianas y diferencias entre la composición de la microbiota entre las especies de anuros. En cuanto a las pruebas de antagonismo, el 52% de las especies identificadas presentaron actividad anti-Bd, siendo diferentes entre los estadios de desarrollo y las especies de anuros evaluadas. Esto indicaría que la microbiota epidérmica cultivable tiene una capacidad antifúngica que confiere la resistencia y permite que estas dos especies de anfibios coexistan con el hongo, sin embargo, las especies que cumplen un efecto en la inhibición de Bd varían dependiendo del estadio.Chytridiomycosis is one of the causes of the massive extinction of amphibians worldwide. Despite the lethality that this disease has shown, there are some frog species that coexist with the fungus that causes it (Batrachochytrium dendrobatidis}, without showing population declines. It is believed that the microbiota present in the skin of these frogs may have an inhibitory effect on Batrachochytrium, which would explain why some populations persist despite the presence of the pathogen. The objective of this research was to determine the anti-Batrachochytrium dendrobatidis activity from the cultivable microbiota present in the epidermis of Dendropsophus labialis and Rheobates palmatus, species that co-occur with the fungus in a pond in Ubaque city, Cundinamarca (Colombia). To recover a greater diversity of microorganisms, two culture medium were used. Subsequently, the antagonistic activity of the species isolated through microarray ELISA plates was evaluated. In total 615 morphotypes were obtained and then classified by MALDI TOF and 16S rRNA gene in 93 species belonging to 35 genera. Species belonging to the genera Pseudomonas, Bacillus, Chryseobacterium, and Arthrobacter were dominant. The Shannon and Simpson indices that indicated high diversity of bacterial species and differences between the compositions of the microbiota between species of frogs. For antagonism test, 52% of the identified species had anti-Bd activity, being different between the stages of development and species of frogs. This would indicate that epidermal cultivable microbiota has an antifungal capacity that conferred resistance to the disease and allows these two amphibian species coexist with the fungus, however, the bacterian species that play an inhibiting effect varies depending on the stage.Biólogo (a)Pregrad