預測癌症差異性表達基因－ t-檢定與SAM方法比較

[[abstract]]本研究主要是比較兩種差異性表達基因的預測方法在發現癌症相關基因的準確性。這兩種方法分別應用在探討致癌基因 (Oncogene)及腫瘤抑制基因 (Tumor suppressor gene)、癌症相關基因（Other）於肝癌、食道癌、乳癌這三種癌症。藉由EBI ArrayExpress 所提供下載肝癌、食道癌、乳癌三種組織的Microarray 實驗資料，分別利用t-test檢定與SAM( Significance Analysis of Microarrays)這一套預測工具，進行差異性表達基因篩選，將預測出來的差異性表達基因與已知的致癌基因 (Oncogene) 、腫瘤抑制基因 (Tumor suppressor gene)或癌症相關基因（Other）進行基因比對。在食道癌、乳癌t-test 有較好的表現，而在肝癌上SAM 有較好的表現。最後建立網頁將結果提供查詢， 網址為：http://ppi.bioinfo.asia.edu.tw/P_Cancer_T_SAM