Recherche de gènes d'avirulence de Plasmopara viticola : construction et analyse de banques d'ADNc

Le mildiou de la vigne, causé par l'oomycète Plasmopara viticola, est l'une des maladies cryptogamiques les plus importantes chez la vigne cultivée. Une alternative respectueuse de l'environnement aux méthodes de lutte coûteuses et polluantes exclusivement basées sur l'utilisation de fongicides est l'utilisation de variétés de vigne résistantes à P. viticola. À l'INRA de Colmar, nous avons en charge un programme d'amélioration de la vigne pour la résistance au mildiou basé sur l’exploitation de plusieurs sources de résistance issues de Vitis et l'espèce apparentée Muscadinia rotundifolia. L'analyse des populations de ségrégation a conduit à l'identification de plusieurs gènes majeurs et de QTL de résistance au mildiou. Mais, face aux avancées dans la compréhension des gènes de résistance des Vitacées au mildiou, on ne connaît rien des gènes d'avirulence (Avr) de P. viticola leur correspondant. L'identification de ces gènes d'avirulence est importante non seulement pour mieux comprendre les mécanismes de résistance, mais aussi pour aborder des questions plus pratiques comme le risque de contournement des résistances ou la conception de stratégies de déploiement des résistances. Les gènes Avr récemment isolés à partir des oomycètes des genres Hyaloperonospora et Phytophtora sont spécifiquement surexprimés au cours de l'infection, codent pour de petites protéines extracellulaires, possèdent un motif RXLR et leur expression en présence du gène de résistance correspondant cause une réponse d’hypersensibilité. Ces données permettent d'envisager une approche gène candidat sur ces critères pour identifier les gènes Avr de P. viticola. En conséquence, notre projet a débuté par la création d’une banque de ADNc de P. viticola enrichie avec des séquences induites au cours de l’infection. Nous présenterons la construction et l’analyse de banques d’ADNc produite à partir de spores de P. viticola germées in vitro et de feuilles de vigne infectées, et nous discuterons la pertinence de cette stratégie pour atteindre nos objectifs de recherche