Modélisation dynamique et générique de pathosystèmes fongiques aériens Application à l’étude des impacts du changement climatique sur la rouille brune du blé et le mildiou de la vigne

Le changement climatique (CC) influence le développement des maladies des plantes et leur répartitiongéographique. Ainsi, pour adapter l’agriculture à ces nouvelles conditions, des outils de compréhensionet de prévision du fonctionnement d'une large gamme de pathogènes sont nécessaires. Ce travail a eucomme objectif de développer un modèle générique, mécaniste et dynamique de maladies fongiquesaériennes à coupler à un modèle de fonctionnement des cultures.Une analyse bibliographique a permis d’identifier les principaux types de réponses des pathogènes auxfacteurs du système plante-climat-pathogène. Selon les processus épidémiologiques concernés, desfonctions de réponse génériques ont été identifiées ou développées. Le modèle construit, MDMA, simulel’enchaînement de monocycles épidémiques à l’échelle du cycle cultural via une structure modulaire etcalcule la dynamique de sévérité de maladie (% de surface malade).Le modèle MDMA couple au modèle STICS a été ensuite appliqué à la rouille brune (Puccinia triticina)du blé (Triticum aestivum) et au mildiou (Plasmopara viticola) de la vigne (Vitis vinifera). Sa calibrationet évaluation sur des données observées ont montré son aptitude à reproduire des dynamiques de sévéritéde ces deux pathosystèmes.Enfin, une étude d’impacts du CC sur ces deux pathosystèmes a été réalisée sur trois sites représentatifsdes grands climats français, Avignon, Bordeaux et Dijon, à partir du scénario d’émission de gaz à effetde serre A1B. Le modèle a permis de comprendre l’évolution des principales étapes de la maladie, endistinguant l’effet direct de l’effet indirect (via la plante) du climat. Ainsi, une augmentation générale desévérité de rouille brune due à l’augmentation des températures favorisant la réalisation des cyclesépidémiques hivernaux est attendue. La sévérité du mildiou tend à diminuer en raison de la baisse depluviométrie. Cette étude a mis en évidence le besoin d’une connaissance approfondie du fonctionnementdes pathosytèmes face aux nouvelles conditions climatiques attendues