Etude de la microflore endophyte colonisant le bois de ceps ayant exprimés ou non les symptômes foliaires d'une maladie du bois de la vigne l'Esca.

Il est actuellement estim´e que les maladies du bois de la vigne rendent improductif environ 11% du vignoble francais. Le developpement de l’Esca (la principale maladie du bois de la vigne) a été étudié en comparant chez des plants relativement jeunes (10 ans), matures (20-25 ans) et âgés (58 ans), ayant exprimé ou non des symptômes d’Esca, la microflore fongique et bactérienne qui colonise le bois des ceps. Chez les ceps jeunes, les analyses réalisées par technique d’empreinte moléculaire, i.e. par SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) indiquent une évolution de la microflore fongique en fonction des mois de prélèvement des échantillons de bois (un prélèvement par saison). Cette évolution est nette entre janvier et avril mais elle n’est pas ou peu observée entre jui et septembre. Pour la microflore bact´erienne, cette ´evolution est très marquée tout au long de l’année.Il est important de noter que les communautés bactériennes colonisant les plants asymptomatiques et symptomatiques se diff´erencient uniquement en hiver. Pour les communautés fongiques, il semblerai qu’il y ait aussi une s´eparation en hiver, n´eanmoins elle est moins accentu´ee que pour les bactéries. Les communautés fongiques et bactériennes sont généralement plus abondantes dans les tissus non nécrosés que dans les tissus nécrosés, elles sont aussi généralement différentes dans les 2 types de bois. De nombreux champignons potentiellement pathogènes ou potentiellement protecteurs (au moins 90 espèces et 44 genres) colonisent le bois sain de jeunes plants de vigne âgés de 10 ans, une compétition entre ces différents champignons existe certainement au sein du tronc. Lorsque les ceps sont plus matures (20-25) ou âgés (58 ans) le développement des nécroses est de plus en plus prononcé. Seules quelques espèces fongiques particulières colonisent ces zones nécrosées. Des analyses des communaut´es cultivables ainsi que des approches de séquençage sont utilisées pour répondre aux questions suivantes : pourquoi l’importante diversité microbienne observée chez les ceps jeunes tend `a syst´ematiquement diminuer chez les plants matures et âgés ? Quels sont les facteurs responsables de cette évolution ? Quel est le rôle des bactéries colonisant le bois sain des ceps, en particulier chez les plants jeunes ? Ces points seront discutés