Régulation spécifique des clusters botrydial et acide botcinique chez Botrytis cinerea

Botrytis cinerea est l’agent pathogène responsable de la pourriture grise qui touche plus de 200 espèces végétales. Parmi les facteurs de virulence identifiés chez ce champignon ascomycète figurent deux toxines (et leurs dérivés respectifs) ayant un rôle redondant dans la nécrotrophie. Il s’agit du sesquiterpène botrydial (BOT) et du polycétide acide botcinique (BOA). Les gènes responsables de leur synthèse sont agencés en clusters au sein du génome comme dans la plupart des cas pour les gènes du métabolisme secondaire chez les champignons. Des études précédentes ont permis de mettre en évidence la régulation de ces clusters par des voies de transductions conservées de type MAP kinases ainsi que par des facteurs de transcription globaux comme le facteur de transcription calcineurine-dépendant BcCrz1. De plus, un fort lien entre l’expression de ces gènes du métabolisme secondaire et le développement en réponse à la lumière a été démontré chez l’agent de la pourriture grise, notamment par la caractérisation des membres du complexe Velvet BcVel1 et BcLae1. Des données de régulation globale sont donc disponibles pour les gènes Bcbot et Bcboa mais leurs régulateurs directs n’ont pas été caractérisés. D’après de nombreux exemples de la littérature, lorsqu’un gène codant un facteur de transcription se trouve au sein d’un cluster du métabolisme secondaire, la protéine produite régule spécifiquement les gènes du cluster. Parmi les gènes Bcboa, Bcboa13 est prédit pour coder un facteur de transcription de type Zn(II)2Cys6. D’autre part, une nouvelle version du génome de B. cinerea a permis de compléter la liste des gènes putatifs du cluster BOT et de mettre en évidence à proximité des gènes Bcbot1 à 5 un gène (Bcbot6) prédit pour coder également un FT de type Zn(II)2Cys6. Dans le cadre de notre étude, la caractérisation fonctionnelle de BcBot6 et BcBoa13 est réalisée. Notre hypothèse est que ces facteurs de transcription sont des régulateurs spécifiques de leur cluster. Les données acquises jusqu’ici via la création de mutants et des analyses d’expression par RT-qPCR confirment cette hypothèse. Afin d’étudier la capacité de BcBot6 et BcBoa13 d’intervenir dans des interactions directes avec les promoteurs Bcbot et Bcboa, une approche par simple hybride est actuellement réalisée. Finalement, la banque de facteurs de transcription dont nous disposons sera criblée pour identifier des régulateurs de Bcbot6 et Bcboa13 afin de faire le lien avec les cascades d’activation déjà̀ connues