Caracterización fenotípica y molecular de poblaciones de alpaca (Vicugna pacos) de las comunidades altoandinas y aplicación al programa de mejora de la calidad de la fibra

El presente trabajo, busca contribuir a los programas de mejora genética que se están emprendiendo en el sector de los Camélidos Sudamericanos para la mejora de la capacidad productiva de la alpaca, incidiendo sobre todo en la calidad de la fibra. Las poblaciones de Alpacas peruanas del presente trabajo proceden de ganaderías localizadas en las comunidades más representativas de la Reserva Nacional de Salinas y Aguada Blanca (RNSAB) que son referentes de producción en la región Arequipa, así como también de ganaderías de la región Puno; otras poblaciones de alpacas (animales con valoración de datos genéticos) proceden de la empresa privada Fundo Experimental Pacomarca de Incatops S.A. Para llevar a cabo la finalidad del estudio se han desarrollado los siguientes objetivos: 1. Estimar los parámetros genéticos en una población de Alpacas de la raza Huacaya, para conocer los valores de la heredabilidad, las correlaciones genéticas y los efectos fijos de las características productivas del vellón. 2. Diagnosticar la variabilidad genética y fenotípica de cinco poblaciones de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) del Perú, mediante el uso de Marcadores Microsatélites y medidas del diámetro de la fibra. 3. Estimar la diversidad genética en poblaciones de alpacas de las razas Huacaya y Suri y la asociación de 69 marcadores microsatélites con un gen mayor que afecta a la característica del diámetro de la fibra de alpaca. Para llevar a cabo los objetivos propuestos se emprendió un estudio preliminar en poblaciones de alpacas de crianza tradicional, en el que se han estimado los parámetros genéticos, las correlaciones entre caracteres del vellón y los efectos fijos. Los resultados señalan altos valores de heredabilidades para los caracteres del diámetro de la fibra y peso de vellón. Por otro lado, la correlación entre los caracteres del peso del vellón y diámetro de fibra fue baja; en cuanto a los efectos fijos se han encontrado valores significativos de la edad con los caracteres del diámetro de la fibra, peso del vellón y longitud de la mecha, y del color de la capa con el diámetro de la fibra y peso del vellón. Una vez conocido el potencial de mejora mediante los resultados obtenidos sobre los parámetros genéticos, correlaciones y efectos fijos, se planteó la realización del estudio de variabilidad molecular y asociaciones de loci al carácter cuantitativo diámetro de la fibra de alpaca. Los resultados nos muestran una alta variabilidad genética en las localidades de San Juan de Tarucani, Estación Pillones, Chalhuanca, Palca y Lampa, encontrando los más altos niveles de diversidad genética en las localidades de Lampa (0.712) y Chalhuanca (0.749), por otro lado se hallo una variación genética del 79% dentro de poblaciones. Se han encontrado asociaciones espurias entre el carácter de diámetro de la fibra y tres loci microsatélite CVRL07, LGU68 y LCA65. Con el objetivo de establecer las primeras bases para una saturación del genoma de la alpaca tendente a la búsqueda de mejores aproximaciones de loci asociados a caracteres cuantitativos (QTL), se realizó el estudio con poblaciones de alpacas de las razas Huacaya y Suri, previamente valoradas para un gen mayor que afecta a dos caracteres de calidad: el diámetro de la fibra y el factor confort. También se estimó la diversidad genética existente en estas dos poblaciones. El estudio ha mostrado niveles favorables de variabilidad genética para las razas de alpacas Huacaya y Suri. Se encontraron asociaciones significativas de los loci LCA68, VOLP59, LCA90 y GLM6 con valores genéticos favorables para el carácter cuantitativo del diámetro de la fibra de alpaca.Los resultados hallados nos permiten concluir, que las poblaciones de alpacas peruanas del presente estudio son un importante recurso genético susceptible para emprender planes de mejora al poseer alta diversidad genética. Por otro lado las asociaciones alélicas de marcadores microsatélite con el diámetro de la fibra abren la posibilidad de emprender planes de mejora en las granjas élite de alpacas