Une approche ontologique pour l'exploitation de données cliniques

National audienceL'utilisation des outils et techniques du web sémantique pour intégrer, modéliser et interroger des bases de données relationnelles est un moyen de prendre en compte la dimension sémantique des données et d'en faciliter l'exploitation. Les données issues des systèmes d'information hospitaliers (SIH) peuvent êtres inutilisables dans leur format d'origine en raison de l'absence d'informations ou de connaissances. Elles nécessitent donc d'être réorganisées et liées à des ressources externes de connaissances telles que des ontologies ou terminologies. Dans le cadre de cette étude, nous utilisons des données opérationnelles du SIH de l'hôpital européen Georges Pompidou, une ontologie comme source de connaissances et des outils du web sémantique pour interroger notre base de données opérationnelle et répondre ainsi à des questions médicales dans le domaine de la résistance des bactéries aux antibiotiques. Le champ d'application de contrôle des infections des parties prenantes de cette étude est délimité par le biais de plusieurs requêtes, par exemple « la liste des patients ayant une infection spécifique (ex : infection urinaire) par un agent pathogène donné (ex : E. coli) résistante à un antibiotique donné (ex : amoxicilline) »