Primers used in the identification of Human Papillomavirus by PCR: a review

Introducción La infección por el virus del papiloma humano (VPH) sigue siendo una de las más comunes en la población humana. Este virus cuenta con aproximadamente 200 genotipos diferentes, que se clasifican en términos de su capacidad oncogénica en alto y bajo riesgo. La identificación de estos genotipos se ha realizado mediante la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), la cual requiere el uso de iniciadores específicos para garantizar resultados precisos. Objetivo. Recopilar secuencias de iniciadores publicados, analizarlos y organizar esta información para proveer una lista compilada que facilite la decisión de optar por la utilización de un par de iniciadores requeridos para la detección y diagnóstico del HPV. Metodología. Se aplicó un enfoque cualitativo, de alcance descriptivo y con un diseño transversal teórico-documental, puesto que se analizó y sintetizó la literatura actualizada extraída de artículos científicos, relacionados con el tema de investigación, los cuales permitieron profundizar la investigación y cumplir con los objetivos planteados. Se revisaron varios artículos de publicación reciente que refieren los iniciadores utilizados. Resultados. Se muestran 17 iniciadores útiles para las variantes de alto riesgo 17 y 15 para las variantes 18, así como para otras variantes. Se expone de manera organizada diferentes aspectos a destacar en su análisis, así como características a tomar en cuenta para su diseño. Además, se mencionan las herramientas de análisis de secuencias las directrices y parámetros requeridos a considerar para asegurar una buena reacción de PCR. Es muy conveniente tomar en cuenta la clasificación taxonómica y estructura del VPH que permite comprender la utilización de un iniciador para un determinado gen del virus. Al momento de necesitar utilizar un determinado iniciador se sugiere tomar en cuenta los más convenientes según los valores obtenidos por las herramientas bioinformáticas y a los autores quienes probaron y publicaron secuencias de detección por PCR. Conclusión. Se muestran 17 iniciadores útiles para las variantes de alto riesgo 16 y 15 para las variantes 18, además de 8 para otros tipos. Además, se muestran parámetros de cada uno que permite tener criterios para decidir su selección.Human papillomavirus (HPV) infection remains one of the most common infections in the human population. This virus has approximately 200 different genotypes, which are classified in terms of their oncogenic capacity into high and low risk. The identification of these genotypes has been carried out using the polymerase chain reaction (PCR) technique, which requires the use of specific primers to guarantee accurate results. Methodology. A qualitative approach was applied, with a descriptive scope and a transversal theoretical-documentary design, since the updated literature extracted from scientific articles related to the research topic was analyzed and synthesized, which allowed the research to be deepened and the objectives met. raised. Several recently published articles that refer to the initiators used were reviewed. Results. Shown are 17 useful primers for high-risk variants 17 and 15 for variants 18, as well as other variants. Different aspects to highlight in its analysis are presented in an organized manner, as well as characteristics to take into account for its design. In addition, sequence analysis tools, guidelines and required parameters to consider to ensure a good PCR reaction are mentioned. It is very convenient to take into account the taxonomic classification and structure of HPV that allows us to understand the use of a primer for a certain gene of the virus. When needing to use a certain primer, it is suggested to take into account the most convenient ones according to the values obtained by the bioinformatics tools and the authors who tested and published PCR detection sequences. Conclusion Shown are 17 useful primers for high-risk variants 16 and 15 for variants 18, plus 8 for other types. In addition, parameters for each one are shown that allow you to have criteria to decide your selection