Strengthening of the national network of laboratories that perform SARS CoV-2 detection by PCR through the development of metrological tools to ensure the quality of measurement results

ilustraciones, diagramas, figuras, fotografíasEl virus SARS CoV-2 es el agente etiológico patógeno causante de la enfermedad COVID-19, la que tuvo un rápido surgimiento de nuevos casos alrededor del mundo ocasionando la declaración de pandemia por parte de la Organización Mundial de la Salud (OMS). Hasta la fecha, se han reportado alrededor de 664.9 millones de casos de COVID-19 alrededor del mundo y 6.7 millones de muertes por esta enfermedad; En este sentido, la detección de nuevos casos es una de las herramientas más utilizadas para hacer seguimiento al avance de la pandemia. A pesar de la existencia de varias estrategias para la detección del virus causante de la enfermedad, en la actualidad por su alta sensibilidad y fácil implementación, el método de referencia es la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR por sus siglas en inglés). En Colombia se conformó la red nacional de laboratorios para la detección del virus SARS-CoV-2, coordinada por el Instituto Nacional de Salud (INS), como un mecanismo para ampliar la capacidad de detección de casos positivos a nivel nacional. Con el objetivo de fortalecer ésta red nacional de laboratorios, el INS, en convenio con el Instituto Nacional de Metrología (INM), y con el apoyo de la cooperación internacional, desarrollaron un conjunto de herramientas para apoyar las actividades de aseguramiento de la calidad de los resultados de medición que llevan a cabo cada uno de los laboratorios de esta red; en particular se desarrollaron dos materiales de referencia (MR) a nivel de ARN en solución. Estos fueron caracterizados por PCR en tiempo real y PCR digital, ambas con retrotranscripción (RT), los cuales demostraron ser lo suficientemente homogéneos y estables para ser empleados como Item de Ensayo de Aptitud (IEA), asi como Control Positivo en un Ensayo de Aptitud (EA) para la detección de SARS CoV-2 por técnicas basadas en PCR, y un taller de transferencia técnica, respectivamente. El desarrollo y ejecución de estas actividad permitió identificar posibles debilidades metrológicas de los laboratorios en la detección de secuencias de SARS-CoV-2 por RT-PCR y mejorará la calidad de las mediciones desde la perspectiva de la vigilancia de salud pública. (Texto tomado de la fuente)The SARS CoV-2 virus is the pathogen that causes the disease COVID-19, the rapid emergence of new cases around the world led to the declaration of a pandemic by the WHO. Around 664.9 million cases have been reported around the world and 6.7 million deaths, so the detection of new cases is one of the most used tools to monitor the progress of the pandemic. Despite the existence of several strategies for the detection of the virus that causes the disease, currently the reference method is the Polymerase Chain Reaction (PCR) technique due to its high sensitivity and easy implementation. In Colombia, the national network of laboratories for the detection of the SARS-CoV-2 virus was formed, coordinated by the National Institute of Health, as a mechanism to expand the detection of positive cases nationwide. With the objective of strengthening this national network of laboratories, the INS, in agreement with the National Institute of Metrology INM, as well as with the support of international cooperation, developed a set of tools to support the quality assurance activities of the measurement results carried out by each of the laboratories of this network; in particular, two reference materials (RM) were developed at the level of RNA in solution. These were characterized by real-time PCR and digital PCR, both with reverse transcription (RT), which proved to be sufficiently homogeneous and stable to be used as a Proficiency Test Item (IEA), as well as a Positive Control in a Proficiency Assay. (EA) for virus detection by PCR-based techniques, and a technical transfer workshop, respectively. The development and execution of these activities made it possible to identify possible metrological weaknesses of the laboratories in the detection of SARS-CoV-2 sequences by RT-PCR and will improve the quality of the measurements from the perspective of public health surveillance.MaestríaMagíster en Ciencias - BioquímicaMetrología en bioanálisi