Migrations et fonctionnements des groupes humains entre le Néolithique et l’Âge du Bronze dans le sud de la France : apports de la paléogénomique

Through a multiscale paleogenomic approach, this study aims to document the genetic diversity of human groups in Southern France from the Neolithic to the Bronze Age in relation to the cultural transformations highlighted in the archaeological record. With a regional and diachronic perspective, this study was built around a broad chronological range, spanning from the VIth to the IInd millennium BCE, and a spatial area restricted to the Occitanie region. We focused on a corpus of eleven archaeological sites, totaling 184 analyzed human remains and providing genomic data for 78 individuals. We conducted a population-based approach, documenting regional genetic variability between the Neolithic and the Bronze Age. This allowed us to discuss the transformations in genetic pools and population dynamics identified during both the Mesolithic-Neolithic transition and the IIIrd millennium BCE. Our results reinforce the dichotomy between Continental and Mediterranean Neolithization waves. Mediterranean Neolithic diffusion appears to be associated with smaller groups, characterized by recurrent admixture with Mesolithic groups. The observation of regional genetic variability between the second phase of Neolithization and the first half of the IIIrd millennium BCE also illustrates a relative genetic continuity within the groups of southern France, despite cultural transformations. From the second half of the IIIrd millennium BCE, a different genetic ancestry originating from the Pontic steppes spreads more widely in Western Europe. Our results complement and support previous observations made at the scale of Western Europe, pointing to a later and less pronounced diffusion of this genetic ancestry in Southern France. Additionally, we characterized the genetic diversity of the studied groups at the scale of funerary sites to enhance understanding of the social functioning of these communities and their funerary practices. We extensively documented the Late Neolithic burial cavity of the Aven de la Boucle (Corconne, Gard) using genomic data, archaeo-anthropological data, and Bayesian modeling based on radiocarbon dates. The analyses revealed the existence of a patrilineal system in which the association to a specific paternal lineage and the access to the burial appear to be correlated. Through multiple scales of resolution, our results initiate the filling of a temporal and spatial gap for the groups inhabiting southern France between the VIth and Ist millennium BCE, highlighting the potential of a multidisciplinary paleogenomic approach, thus enabling a better understanding of regional funerary contexts.À travers une approche paléogénomique multiscalaire, ce travail vise à étudier la diversité génétique des groupes humain du sud de la France entre le Néolithique et l’Âge du Bronze au regard des transformations culturelles identifiées dans le registre archéologique. Dans une optique de documentation régionale et diachronique, cette étude a été construite autour d’un intervalle chronologique large, s’étendant entre le VIe et le IIe millénaire avant notre ère, et d’une aire spatiale circonscrite à la région Occitanie. Nous nous sommes ainsi intéressés à un corpus de 11 sites archéologiques, totalisant 184 restes humains analysés et permettant d’obtenir des données génomiques pour 78 individus. Grâce à une approche populationnelle, nous avons pu discuter des transformations des pools génétiques et dynamiques populationnelles identifiées à la fois au cours de la transition mésolithique-néolithique et au cours du IIIe millénaire avant notre ère. Nos résultats renforcent la dichotomie entre les courants de néolithisation continental et méditerranéen. La diffusion néolithique méditerranéenne semble, en effet, associée à des groupes de taille plus restreinte, se démarquant par des phénomènes de métissages récurrents avec les groupes mésolithiques. L’examen de la variabilité génétique régionale entre la seconde phase de néolithisation et la première moitié du IIIe millénaire avant notre ère illustre également une relative continuité génétique au sein des groupes du sud de la France, indépendamment des transformations culturelles documentées. À partir de la seconde moitié du IIIe millénaire, une ancestralité génétique nouvelle issue des steppes pontiques se diffuse plus largement en Europe de l’Ouest. Nos résultats complètent et confortent les observations précédentes à l’échelle de l’Europe occidentale, signalant une diffusion plus tardive et moins marquée dans le sud de la France de cette ancestralité génétique. Parallèlement, nous avons également caractérisé la diversité génétique des groupes étudiés à l’échelle des ensembles sépulcraux, afin d’enrichir la compréhension du fonctionnement social de ces communautés et leurs pratiques funéraires. Nous avons par exemple pu explorer le potentiel d’une approche archéogénomique multidisciplinaire, et son application aux contextes sépulcraux collectifs. Dans ce cadre, nous avons ainsi combiné données génomiques, données archéo-anthropologiques et modélisations bayésiennes à partir des dates radiocarbone afin de mener une documentation extensive de la cavité sépulcrale Néolithique récent de l’Aven de la Boucle (Corconne, Gard). Les analyses ont notamment révélé l'existence d'un système patrilinéaire avec une nette corrélation entre l'appartenance à un lignage paternel spécifique et l'accès à la sépulture. En passant par plusieurs échelles de résolution, l’ensemble de nos résultats amorce le comblement d’une lacune temporelle et spatiale pour les groupes du sud de la France entre le VIe et le Ier millénaire avant notre ère et souligne le potentiel d’une approche paléogénomique pluridisciplinaire et locale, permettant ainsi une meilleure appréhension des contextes funéraires régionaux