Análise epidemiológica, molecular e filogenética de enterovirus isolados de casos de meningites assépticas, encefalites e meningoencefalites ocorridos no Brasil entre os anos de 2009 e 2017

A meningite asséptica (MA) é uma síndrome clínica infectocontagiosa onde há o acometimento das meninges A origem mais comum desta síndrome é a viral, sendo os enterovírus humanos (EV) os principais agentes etiológicos responsáveis pela maioria dos casos em todo o mundo. Os Enterovírus Não-Pólio (EVNP) são os principais responsáveis pelos casos de MA no qual o agente etiológico é identificado, sendo o echovírus 30 (E30) o mais frequente tanto nos surtos como em casos esporádicos no Brasil. A encefalite é definida como a presença de um processo inflamatório no parênquima cerebral e o termo meningoencefalite é utilizado quando há acometimento tanto das meninges quanto do parênquima cerebral. O presente estudo tem como objetivo a análise epidemiológica, molecular e filogenética dos agentes virais envolvidos nos casos de meningites, meningoencefalites e encefalites causadas por enterovírus ocorridos no Brasil entre os anos de 2009 e 2017. No Laboratório de Enterovirus que é Referência para OMS um total de 2890 amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) provenientes de pacientes com quadros suspeitos de MA foram processadas para definição diagnóstica. Um total de 388 (13,4%) amostras foram positivas para EVNP e o sequenciamento nucleotídico destas identificou 19 sorotipos diferentes, sendo a grande maioria incluída na espécie B de enterovírus (HEV-B). O E30 foi o mais frequentemente isolado (44,58%), seguido pelo echovirus 6 (E6, 26,80%). Indivíduos do sexo masculino e com idade entre 1 e 6 anos de vida foram os mais acometidos. Os sintomas mais relatados foram febre (85,98%), vômitos (83,76%), cefaleia (82,65%), e rigidez na nuca (30,26%). A análise filogenética de E30 mostrou uma estreita relação entre os vírus circulantes no Brasil e na America do Sul, além de Estados Unidos, Rússia, Espanha, França, China e Japão, sugerindo diferentes introduções de E30 no Brasil. Os isolados de E6 brasileiros revelaram estreita relação genética entre si e com cepas circulantes em países europeus como Países Baixos e Grã-Bretanha. Estudos sistemáticos sobre os agentes etiológicos envolvidos nos casos de MA no Brasil não são encontrados atualmente na literatura. O vasto território brasileiro associado à detecção recorrente de E30/E6 ao longo dos anos e a alta capacidade de recombinação desses vírus mostraram a importância da vigilância dos enterovírus no contexto da meningite assépticaAseptic meningitis is an infectious and contagious clinical syndrome where meninges are affected. The most common origin of this syndrome is viral, with human enteroviruses (EV) being the main etiologic agents responsible for most cases worldwide. Non-Polio Enteroviruses (NPEV) are mainly responsible for cases of AM in which the etiologic agent is identified, with echovirus 30 (E30) in Brazil being the most frequent, both in outbreaks and in sporadic cases. Encephalitis is defined as the presence of an inflammatory process in the cerebral parenchyma and the term meningoencephalitis is used when both meninges and brain parenchyma are involved. The present study aims at the epidemiological, molecular and phylogenetic analysis of the viral agents involved in the cases of meningitis, meningoencephalitis and encephalitis caused by enteroviruses that occurred in Brazil between the years 2009 and 2017. At the Enterovirus Laboratory a total of 2890 cerebrospinal fluid (CSF) samples from patients with suspected MA were processed for diagnostic definition. Nucleotide sequencing was performed on the 388 positive samples for NPEV. Nineteen different serotypes were identified, the large majority corresponded to HEV-B species. Echovirus 30 being the most frequently isolated, presenting positivity in 173 (44.58%) samples, followed by echovirus 6 with 104 (26.80%) samples, affecting mainly male individuals and aged between 1 and 6 years of life. The most commonly reported symptoms were fever (85,98%), vomiting (83,76%), headache (82,65%) and neck stiffness (30.26%). Phylogenetic analysis of E30 showed a close relationship between viruses circulating in Brazil and South America, in addition to other countries, such as the United States, Russia, Spain, France, China and Japan, suggesting different introductions of E30 in Brazil. The Brazilian E6 isolates revealed a close genetic relationship with each other and with strains circulating in European countries such as the Netherlands and Great Britain. Currently, there are no systematic studies on the etiological agents involved in MA cases in Brazil in the literature. Previous studies, as in this work, also reported the prevalence of echovirus 30. The vast Brazilian territory associated with the recurrent detection of E30 / E6 over the years and the high capacity for recombination of these viruses showed the importance of enterovirus surveillance in the context of aseptic meningitis89 f