Análisis estructural de proteínas bHLH-PAS sobreexpresadas en varios tipos de cáncer.

La inhibición del factor inducible por hipoxia-1 alfa (HIF-1α) ha surgido en los últimos años como un objetivo atractivo para el desarrollo de nuevas terapias contra el cáncer. Otras proteínas análogas tienen un papel importante en el cáncer. La información estructural en las regiones N-terminales AhR, HIF-1 y 2 alfa, incluidos los dominios del bucle de hélice básico (bHLH) y Per-ARNT-Sim (PAS) son importantes para las heterodimerizaciones de AhR: ARNT, HIF-1α: ARNT y HIF-2α: ARNT. La dimerización de estas proteínas con la proteína de translocación nuclear AhR (ARNT), ambas pertenecientes a la familia básica de factores de transcripción Helix-loop-helix Per-ARNT-Sim (bHLH-PAS), es un paso clave en el mecanismo de inducción. de una expresión génica dependiente para promover un crecimiento tumoral. Proponemos determinar las principales características estructurales de las proteínas monoméricas AhR, HIF-1α y HIF-2α en la región relacionada con el proceso de dimerización. Se realizaron superposiciones a partir de las secuencias de cada proteína para la región relacionada con la dimerización utilizando el programa MOE 2019.01. Para las múltiples alineaciones se utilizó el servidor Clustal Omega. Las superposiciones estructurales de ApoAhR, HIF-1α y HIF-2α en la región de la proteína relacionada con la dimerización, muestran similitud por ser proteínas homólogas del tipo bHLH-PAS. Las proteínas presentan diferentes porcentajes de identidad: ApoAhR / HIF-1α (28,99%), ApoAhR / HIF-2α (25,32%) y HIF-1a / HIF-2a (68,39%). Tienen en común 16 regiones estructurales generales (6 hélice α y 10 láminas β). Se identificaron 66 residuos de aminoácidos diferentes en los dominios bHLH-PAS de HIF-1α y HIF-2α. Palabras clave: Biología estructural, Cáncer, Factor Inducible por Hipoxia, Proteínas bHLH-PAS, Receptor de Hidrocarburos de Arilo