Molecular Modeling and in Silico Characterization of a Pathogenesis-Related Protein-10 (PR10) and its Coding Genes in some Oryza Species

يعد الأرز أحد الأطعمة الأساسية لأكثر من ثلثى سكان العالم مما يسترعى الإهتمام بالتحسينات الوراثية التى تزيد الكفأءة الحقلية لهذا المحصول الهام. و نظرا لقلة التباينات الوراثية فى الانواع المزروعة مقارنة بتلك الموجودة فى الأنواع الأخرى لجنس Oryza توجب الاهتمام بدراسة المحتوى الجينى لتلك الانواع الاخرى. تهدف هذه الدراسة الى وصف و توضيح أحد البروتينات المرتبطة بالآفات من المجموعة العاشرة (PR10) - لما لتلك المجموعة من أهمية فى مكافحة الإجهادات الحيوية و الغير الحيوية -  و كذلك الجينات الخاصة بها فى عدد من أنواع جنس Oryza (O. sativa, O.  barthii, O. glaberrima, O. glumipatula, O. meridionalis, O. nivara, O. rufipogon and  O. punctata.) بٍإستعمال التقنيات الحاسوبية. و قد كشفت الدراسة تنوععاً محدوداً لهذا البروتين و الجين الخاص به فى كافة الأنواع عدا O. glumipatula الذى أظهرت الدراسة إختلافاً تركيبياً فى البروتين موضوع الدراسة به مقارنةً بالبروتين ذاته فى الأنواع Oryza الأخرى. و تستوجب هذه النتائج الإهتمام بالمحتوى الجينى لهذا النوع لما قد يحمله من فائدة فى مواجهة الأنواع المختلفة من الإجهادات و التى تتطلب مزيداً من الدراسة للإستفادة منها فى برامج تربية الأرز.Rice is a major staple food for more than two thirds of the world population. Pathogenesis-related proteins-10 (PR10) have a range of 154 to 163 amino acid with molecular weight ~ 17 kDa.  They are acidic and generally intracellular and cytosolic proteins accumulate in plants in response to biotic and abiotic stresses. In the present study, a PR10 gene and its corresponding protein were characterized in O. sativa, O.  barthii, O. glaberrima, O. glumipatula, O. meridionalis, O. nivara, O. rufipogon and  O. punctata. The results revealed a narrow range of variation at both DNA and protein levels in all examined species except O. glumipatula. The latter showed a relatively obvious structural variation at protein level. Such variation may be beneficial against different types of stress that requires further elucidation to exploit in rice breeding programs