La génétique inverse appliquée au développement d’outils thérapeutiques contre les virus émergents

Dans le contexte actuel, où l’émergence et la réémergence de pathogènes viraux ne cessent de croître et constituent un problème majeur de santé publique, le développement de nouveaux outils thérapeutiques est indispensable. L'ingénierie des virus recombinants est un outil prééminent pour déchiffrer la biologie des agents pathogènes viraux émergents tels que les Coronavirus, les Artérivirus ou encore les Flavivirus. Cependant, la grande taille et la complexité des génomes de certains de ces virus rendent les méthodes actuelles de génétique inverse difficiles. Ici, nous décrivons une méthode simple basée sur la technologie des « amplicons sous-génomiques infectieux » (ISA) pour générer des virus infectieux recombinants, ceci sans avoir besoin de reconstruction de l'ADNc génomique complet ni de clonage. Cette technique a été appliquée avec succès aux virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin (PRRSV), du coronavirus entérique félin (FeCoV), du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SARS-CoV-2) et de l’encéphalite à tiques (TBEV).Nous avons réussi à obtenir des virus recombinants « sauvages » avec des caractéristiques biologiques similaires aux souches d'origine pour l’ensemble de ces virus. Egalement, des mutations spécifiques et des gènes rapporteurs rouges fluorescents (mCherry) ont été incorporés dans le génome du SARS-CoV-2 et du TBEV permettant leur utilisation dans différents domaines de la virologie. En effet, les souches virales générées de novo ont pu être utilisées avec des essais de séroneutralisation ainsi que pour des tests de molécules antivirales. La rapidité et la simplicité de la méthode ISA a le potentiel d’accroître la génération de virus par génétique inverse, afin d'explorer les propriétés biologiques des virus et d'accélérer le développement de composés thérapeutiques efficaces. Cette méthode polyvalente, permettrait aussi de générer des souches génétiquement modifiées et atténuées pour le développement éventuel de candidats vaccins