Phytophthora-genomics: nieuwe mogelijkheden en uitdagingen

Het onderzoek aan de ziekteverwekker Phytophthora infestans is in een stroomversnelling geraakt. Dit is grotendeels te danken aan de stormachtige ontwikkelingen in genomics en de nieuwe inzichten die uit het genoomonderzoek voortvloeien. De DNA-code van het genoom van Phytophthora infestans en van enkele verwante soorten is ontrafeld en via internet beschikbaar. We staan pas aan het begin van het ontginnen van een schat aan gegevens die in de genoomsequentie verborgen ligt maar er zijn nu al verrassende vindingen gedaan die kunnen leiden tot nieuwe strategiëen voor de bestrijding van de aardappelziekte. De moleculaire basis van de 'gen-om-gen'-interactie tussen aardappel en Phytophthora infestans wordt steeds duidelijker en we kunnen, op basis van geconserveerde motieven in effectoreiwitten, genen aanwijzen die een rol spelen in gastheerspecifiteit. Nu kunnen we bestaande theoriën gaan staven met experimentele bewijzen en voorspellingen doen over de duurzaamheid van resistentiegenen. We hebben genen gevonden die coderen voor eiwitten die niet voorkomen in andere organismen en daarom mogelijk interessante aangrijpingspunten zijn voor nieuwe Phytophthora-bestrijdingsmiddelen of een ingang bieden voor alternatieve vormen van bestrijding. Er is nu onomstotelijk bewijs dat Phytophthora, ondanks zijn schimmelachtige uiterlijk, niet tot schimmelrijk behoort maar groene voorouders heeft die over fotosynthetiserende organellen beschikte