Técnicas microbiológicas y moleculares para la identificación de Salmonella sp en la industria avícola: una revisión sistemática de alcance

A systematic review of the diagnostic methods described in the literature for the identification and characterization of species of the genus Salmonella was carried out. The review was carried out using publications from 2015 to 2021 registered in the NCBI/PubMed, ScienceDirect, Scopus, SciELO, Google Scholar and Springer databases and applying the PRISMA methodology. In total, 61 articles were analysed, grouping the data according to country of origin, type of sample, technique, microbiology protocol and genes used in molecular tests. The microbiology protocols are based on performing pre-enrichment in peptone water and enrichment in tetrathionate (TT) and Rappaport-Vassiliadis (RV) broths, especially with faecal or environmental samples, to subsequently carry out isolations in selective and differential media. The identification of some Salmonella sp serovars that cause disease in poultry is mainly done with molecular techniques such as conventional PCR and multiplex PCR, based on the detection of genes such as invA, hilA, fliC, sefA, spvC, pefA, speC y glgC. Molecular tools are an alternative to traditional microbiology and serotyping techniques with the White-Kauffmann-Le Minor methodology, as they require less time and can identify serovars; however, microbiological tools such as enrichment contribute to the step prior to the use of other diagnostic tools.Se realizó una revisión sistemática de los métodos de diagnóstico descritos en la literatura para la identificación y caracterización de especies del género Salmonella. La revisión se realizó utilizando publicaciones de 2015 a 2021 registradas en las bases de datos de NCBI/PubMed, ScienceDirect, Scopus, SciELO, Google Scholar y Springer, aplicando la metodología PRISMA. Se analizaron 61 artículos, agrupando los datos según el país de origen, tipo de muestra, técnica utilizada, protocolo de microbiología empleado y genes utilizados en las pruebas moleculares. Los protocolos de microbiología se basan en pruebas de pre-enriquecimiento en agua peptonada y enriquecimiento en caldos de tetrationato (TT) y Rappaport-Vassiliadis (RV), especialmente con muestras de heces o muestras ambientales, para posteriormente realizar los aislamientos en medios selectivos y diferenciales. La identificación de algunas serovariedades de Salmonella sp que causan enfermedad en las aves se realiza principalmente con técnicas moleculares (PCR convencional y PCR multiplex), basándose en la detección de genes como invA, hilA, fliC, sefA, spvC, pefA, speC y glgC. Las herramientas moleculares son una alternativa a las técnicas tradicionales de microbiología y serotipificación con la metodología White-Kauffmann–Le Minor, por requerir de menos tiempo y poder identificar a los serovares; sin embargo, las herramientas microbiológicas como el enriquecimiento contribuyen en el paso previo al empleo de otras herramientas diagnósticas