Approche moléculaire du transport d'ions pour la calcification chez les coraux symbiotiques et non-symbiotiques

The construction and maintenance of coral reefs primarily depends on the calcification of corals, which produce a rigid skeleton made of CaCO3 in the crystalline form of aragonite. Most reef-building corals live in symbiosis with photosynthetic dinoflagellates of the Symbiodiniaceae family, which provide the coral host with energy and nutrients. Given their ecological importance, much progress has been made in identifying key elements of the mechanisms underlying coral calcification. Nevertheless, there are still significant gaps in our understanding. Foremost is the characterization of ion transporters, used by the coral calcifying cells to promote calcification. To contribute to this lack of knowledge, targeted and broad approaches, coupled with molecular and bioinformatics tools, have been used throughout this thesis. Using the targeted approach, ion transporter proteins, previously reported to be involved in calcification of other calcifying species, have been identified for the first time in the genome and transcriptome of the symbiotic coral Stylophora pistillata. Whereas, using a broad approach, novel candidate genes for roles in calcification have been identified in the non-symbiotic coral Tubastraea spp. Overall, both approaches contributed to a better understanding of the ion transporting mechanisms used by the coral calcifying cells to promote calcification in this ecologically important group of marine animals.La construction et le maintien des récifs coralliens dépendent essentiellement de la calcification des coraux, organismes qui produisent un squelette rigide fait de CaCO3, sous la forme cristalline d'aragonite. La plupart de ces coraux vivent en symbiose avec des dinoflagellés photosynthétiques de la famille des Symbiodiniaceae, qui fournissent de l'énergie et des nutriments à l'hôte corallien. Compte tenu de l'importance écologique des coraux constructeurs de récifs, de nombreux progrès ont été réalisés dans l'identification des mécanismes à la base de la calcification des coraux. Néanmoins, il existe encore des lacunes importantes dans la compréhension de ce processus, dont la caractérisation des transporteurs d'ions, utilisés par les cellules calcifiantes pour promouvoir la calcification. Pour contribuer à ce manque de connaissances, des approches ciblées et générales, couplées à des outils moléculaires et bioinformatiques, ont été utilisées tout au long de cette thèse. En utilisant l'approche ciblée, j'ai recherché, dans le génome et le transcriptome du corail symbiotique Stylophora pistillata, des protéines de transport d'ions, précédemment rapportées comme étant impliquées dans la calcification d'autres espèces calcifiantes. En utilisant une approche générale, j'ai étendu la recherche de gènes candidats chez le corail non symbiotique Tubastraea spp. Les deux approches ont contribué à une meilleure compréhension des mécanismes de transport d'ions utilisés par les cellules calcifiantes du corail pour favoriser la calcification dans ce groupe d'animaux marins écologiquement important