Ecologie trophique des requins de Basse Californie du Sud (Mexique) : répartition de la ressource, changement ontogénétique et perspectives de conservation

Characterizing the trophic ecology of sharks is fundamental to understand the potential cascading effects of their current décline in marine ecosystems. This thesis investigates the trophic niches of shark species in Coastal and offshore ecosystems around Baja California Sur (Mexico) in both the Pacific Ocean and the Gulf of California, a region characterized by a strong pressure from artisanal fisheries. Ecologically, the guiding thread was to elucidate the importance of resource partitioning in shaping shark realized trophic niches, at both the intra- and inter-specific level. To achieve this objective, multiple trophic biomarkers were used, such as carbon, nitrogen and mercury stable isotopes, and fatty acid compositions, to describe the vertical and horizontal dimensions of shark foraging habits.At the intra-specific level, resource partitioning was supported by the use of distinct ecosystems for juvenile hammerhead sharks due to ontogenetic shifts in habitat and prey. Inter-specific resource partitioning seems to be driven by foraging at different depth within pelagic assemblages, but could also depend on local environmental conditions, such as upwelling activity. This work also characterized the life cycle of a poorly studied hammerhead species, the smooth hammerhead shark (Sphyrna zygaena). The prolonged Coastal residency of this species through ontogeny suggests significant vulnerability to local artisanal fisheries. Finallly, the demonstrated complementarity of trophic markers provides a promising insight to unravel food web structure and ecological mechanisms.Décrire la niche trophique occupée par les requins est fondamental dans la compréhension du contrôle trophique qu'ils exercent sur les communautés associées et des potentielles conséquences de leur surpêche sur le milieu marin. Dans cette thèse, l'habitat alimentaire de différentes espèces de requins a été étudié le long des côtes de Basse Californie du Sud (Mexique), une région où la pression de pêche sur ces prédateurs est forte. D’un point de vue écologique, l’idée directrice était de décrire l’importance de la répartition de la ressource dans la définition des niches trophiques à l’échelle intra- et inter-spécifique. Pour cela, plusieurs outils ont été utilisés tels que les isotopes stables du carbone, de l’azote et du mercure, ainsi que la composition en acides gras permettant la description verticale et horizontale des habitats alimentaires. À l’échelle intra-spécifique, la répartition de la ressource chez les requins marteaux juvéniles est liée à l’utilisation d’écosystèmes et de proies distincts au cours de la croissance. À l’échelle inter spécifique, elle s’exprime par des différences de profondeur d’alimentation au sein des assemblages pélagiques, mais dépend aussi des conditions environnementales telles que la présence d’upwelling. Ce travail a également conduit à une meilleure caractérisation du cycle de vie du requin marteau commun (Sphyrna zygaena), démontrant ainsi une vulnérabilité accrue aux pressions de pêche liée à une résidence prolongée en milieu côtier. Finalement, la complémentarité des marqueurs trophiques utilisés offre de prometteuses perspectives quant à l’étude des réseaux alimentaires