Análisis proteómico de la oncoproteína nucleofosmina

[ES] El presente trabajo titulado “Análisis proteómico de la oncoproteína nucleofosmina” tiene por objetivo estudiar el papel de la nucleofosmina (NPM1) en la respuesta al daño al DNA y cómo podría estar alterada su función en la leucemia mieloide aguda (AML). El método utilizado es un análisis proteómico comparativo de las variantes salvaje y mutante de la NPM1. Para el análisis, se sobreexpresan las proteínas en células HEK293T, se aíslan los complejos de NPM1 mediante el método GFP-Trap y se hace una electroforesis desnaturalizante (SDS-PAGE). Las muestras se analizan en el Servicio de Proteómica de la Universidad de País Vasco (SGIker) por medio de la técnica analítica de espectrometría de masas (MS). El listado de proteínas obtenido por MS se trató estadísticamente con el programa bioinformático Perseus. Los resultados revelan cuáles son los ligandos enriquecidos en la NPM1 salvaje y mutante. Entre aquellos enriquecidos en el mutante frente a la NPM1 salvaje destaca la proteína SKP1 implicada en proliferación celular y también se han identificado ligandos relacionados con leucemia y otros tipos de cáncer (FUS y SIRT5). Por su parte, la proteína salvaje muestra enriquecidas las polimerasas POLR1D y POLR2K que intervienen en procesos de respuesta al daño del DNA. En cuanto al papel de NPM1 en reparación se ha estudiado la interacción con APE1, proteína implicada en las vías de reparación por escisión de bases (BER). En este trabajo se destacan algunas proteínas que pudieran resultar útiles para el desarrollo de futuras tratamientos para la AML