Identifikasi Isolat Actinomycetes Asal Sedimen Mangrove Segara Anakan Cilacap Menggunakan Metode Numerik-Fenetik

Actinomycetes termasuk ke dalam kelompok bakteri Gram positif dan dapat dikenali dari struktur morfologi yang khas yaitu miselium. Actinomycetes dapat ditemukan pada ekosistem mangrove dan kawasan Segara Anakan menjadi salah satu contoh lingkungan yang dapat menjadi sumber Actinomycetes. Laboratorium Mikrobiologi Fakultas Biologi memiliki 9 isolat Actinomycetes asal sedimen mangrove Segara Anakan Cilacap yang perlu diketahui lebih lanjut identitasnya secara numerik-fenetik. Identifikasi bakteri dapat dilakukan dengan cara melihat karakterkarakter yang dimiliki oleh bakteri tersebut. Tujuan penelitian ini yaitu untuk mengetahui hubungan kekerabatan isolat Actinomycetes asal sedimen mangrove Segara Anakan Cilacap dan mengetahui identitasnya dengan metode numerik-fenetik. Penelitian ini dilakukan menggunakan metode survei dan karakterisasi dilakukan menggunakan metode konvensional. Variabel bebas penelitian berupa isolat Actinomycetes asal sedimen mangrove Segara Anakan yang belum teridentifikasi secara numerik fenetik, sedangkan variabel terikat adalah hubungan kekerabatan isolat Actinomycetes. Parameter yang diamati adalah indeks similaritas dan identitas isolat Actinomycetes. Data yang diperoleh kemudian dianalisis menggunakan metode numerik-fenetik untuk melihat hubungan kekerabatan antar isolat. Identifikasi isolat Actinomycetes mengacu pada buku Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebanyak 9 isolat Actinomycetes asal sedimen mangrove Segara Anakan Cilacap yang terbagi ke dalam 2 klaster dan 1 subklaster memiliki hubungan kemiripan yang tinggi dengan nilai similaritas ≥70% berdasarkan metode numerik-fenetik. Klaster pertama memiliki nilai similaritas berkisar 78-88% dengan nilai similaritas tertinggi dimiliki oleh hubungan antara isolat SA91 dan SAE4034. Klaster kedua memiliki nilai similaritas berkisar 74-96% dengan nilai similaritas tertinggi dimiliki oleh hubungan antara isolat SA411 dan SAE127. Subklaster memiliki nilai similaritas 94%-96% dengan nilai similaritas tertinggi dimiliki oleh hubungan antara isolat SAC4536 dan SAE40332. Sebanyak 6 isolat Actinomycetes yaitu SAE4034, SA91, SA32, SAE404, SAE127, dan SA411 merupakan spesies anggota genus Streptomyces. Sebanyak 2 isolat yaitu SAE40332 dan SAC4536 merupakan genus tersendiri, bukan termasuk ke dalam genus Streptomyces