Terapia dirigida orientada por estudios moleculares en linfoma de células T

Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Bioquímica. Fecha de Lectura: 17-06-2022Los linfomas de células T (TCL) son un grupo heterogéneo de linfomas agresivos. Su clasificación es compleja y requiere la integración de información sobre factores clínicos, morfológicos y moleculares. En su mayoría poseen un pronóstico desfavorable, debido a nuestro conocimiento insuficiente sobre la patogenia molecular de estos tumores, la disponibilidad limitada de herramientas terapéuticas y una respuesta inadecuada a las terapias actuales, destacando así la necesidad de tratamientos dirigidos. En el primer trabajo de esta tesis se ha analizado el valor terapéutico potencial del inhibidor de la farnesiltransferasa, tipifarnib, en 25 líneas celulares de TCL. Se pudieron identificar el estado mutacional de NOTCH1 y la activación de ERK por IHC como biomarcadores potenciales de sensibilidad a tipifarnib, y un alto nivel de expresión de RelB como biomarcador de resistencia. Se comprobó también que el tipifarnib inducía la apoptosis y modificaba el ciclo celular. Datos de RNA-seq muestran que tipifarnib regula a la baja una gran variedad de vías, incluidas las que controlan el ciclo celular, el metabolismo y la actividad ribosómica y mitocondrial. En la segunda parte de la tesis se llevaron a cabo estudios de expresión génica y mutacionales comparativos de los diversos tipos histológicos de Linfoma T Periférico (PTCL): linfoma de células T angioinmunoblásticas (AITL); PTCL con fenotipo T folicular (TFH); PTCL no especificado (NOS), mediante paneles personalizados de genes en muestras en parafina. Se identificaron firmas de genes que permitieron estratificar a cada subtipo en diferentes grupos de riesgo, incluyendo marcadores TFH, marcadores citotóxicos y genes específicos de subpoblaciones celulares específicas. La expresión de genes propios de células B es un factor pronóstico independiente del IPI para AITL. El estudio del perfil mutacional arrojó diferencias entre las 3 clases de Linfoma T periférico, así, las mutaciones RHOAG17V fueron aproximadamente dos veces más frecuentes en casos AITL que en PTCL-TFH y no se detectaron en PTCL-NOS. Por último, en la tercera parte de la tesis se llevaron a cabo estudios de expresión génica en muestras de parafina en diferentes fases de la enfermedad en pacientes con Micosis Fungoide (MF) utilizando un panel personalizado de genes relevantes en la patogénesis de MF. Este estudio muestra que la generación de perfiles de expresión génica mediante la plataforma NanoString con un panel personalizado se puede aplicar a muestras de rutina en parafina de MF. Las muestras de MF muestran un alto grado de heterogeneidad intertumoral, lo que sugiere una firma molecular individual que se encuentran en biopsias consecutivas. El análisis también aporta firmas genéticas particulares asociadas con las diferentes fases de la MFLa financiación necesaria para la realización de esta Tesis Doctoral ha sido aportada por el Grupo de Investigación del CIBER de Cáncer (CIBERONC), Instituto Carlos III, mediante los proyectos CB16/12/00291 y PI19/00715; la Asociación Española Contra el Cáncer (AECC) mediante el proyecto PROYE18054PIRI; la Comunidad Autónoma de Madrid (CAM) mediante el proyecto B2017/BMD-3778 y, finalmente, los proyectos PIC97/2017_FJD y PIC 041-19 financiados por KURA ONCOLOGY inc. La autora de la tesis ha disfrutado de contratos asociados a los proyectos PIC97/2017_FJD y CB16/12/00291, así como de una beca PFIS asociada al proyecto PI19/0071