Identification and characterization of orf viruses isolated from sheep and goats in Southern Italy

Orf virus (ORFV; Family: Poxviridae) is the causative agent of contagious ecthyma, or Orf disease in sheep, goats and other domestic or wild ruminants with a worldwide distribution. The disease is endemic in Italy, but few data are available about its distribution and epidemiology. In the present study we analysed 32 clinical samples, obtained from crusted scab lesions of 5 goats and 27 sheep, from 19 suspected outbreaks of contagious ecthyma in Apulia and Basilicata regions between 2012 and 2014. Negative staining electron microscopy (EM) and polymerase chain reaction (PCR) targeting the late transcription factor gene (VLTF-1) were used to identify the virus. Isolation was also attempted on BHK-21 cell line. PCR was proved to be more sensitive than EM, as it detected the virus in 28 out of 32 samples, whereas the EM detected it only in 26 out of the 32 samples. The majority of isolated strains forms a monophyletic group; these isolates, according to the VLTF-1 sequencing, are high related to ORFV strains previously shown to circulate in Southern Italy.L'ORF virus (ORFV; Family: Poxviridae) è l'agente causale dell'ectima contagioso, malattia infettiva contagiosa degli ovicaprini e di altri ruminanti domestici o selvatici, con distribuzione mondiale. La malattia è endemica in Italia, ma in letteratura scientifica sono disponibili pochi dati sulla sua distribuzione ed epidemiologia. In questo studio sono stati analizzati 32 campioni clinici (croste cutanee) prelevati da 27 ovini e 5 caprini provenienti da 19 focolai sospetti di ectima contagioso occorsi in Puglia e Basilicata tra il 2012 e il 2014. Per identificare il virus sono state effettuate sia l'analisi morfologica mediante microscopia elettronica (ME), sia una PCR mirata al rilevamento del gene del fattore di trascrizione tardiva (VLTF-1). I ceppi virali sono stati isolati anche su linea cellulare BHK-21. La PCR è risultata essere la metodica più sensibile, evidenziando la presenza di ORF virus in 28 dei 32 campioni analizzati, mentre la microscopia elettronica ha permesso di rilevare il virus solo in 26 dei 32 campioni. La maggior parte degli isolati forma un gruppo monofiletico; essi, sulla base delle sequenze del gene VLTF-1, risultano essere altamente correlati a ceppi di ORF virus già circolanti in Sud Italia in passato