Morphological, morphometric and molecular characterization of Pratylenchus and Radopholus in Musa spp., in the coffee region and Valle del Cauca, Colombia

Ilustraciones, tablasLos nematodos fitoparásitos causan pérdidas entre 30 y 80% de la producción de plátano (Musa AAB Simmonds - Dominico Hartón) y banano (Musa acuminata) en campos altamente infestados. En las zonas de mayor producción de Musa en Colombia, su manejo fitosanitario ha sido limitado por el desconocimiento de las especies de nematodos presentes. Con el propósito de conocer las especies de Pratylenchus y Radopholus asociadas a cultivos de plátano y banano en los departamentos de Caldas, Quindío, y Valle del Cauca se colectaron muestras compuestas de raíces y suelo rizosférico de diferentes sistemas de producción. En el laboratorio de sanidad vegetal de la Universidad Nacional de Colombia, sede Palmira, los nematodos fueron extraídos por el método de Cobb modificado e identificados mediante análisis morfológico, morfométrico (mediciones de caracteres diagnósticos) y molecular (amplificación por PCR y secuenciación del segmento D2-D3 del ARN ribosomal y Citocromo oxidasa subunidad I [COI] del ADN mitocondrial para Pratylenchus e Internal Transcribed Spacer-ITS del ARN ribosomal para Radopholus). Los resultados mostraron, cinco poblaciones de P. araucensis, así: dos del Valle del Cauca, dos de Quindío y una de Caldas, lo cual indica que esta especie de nematodo, previamente reportada en Arauca (Colombia), se encuentra ampliamente distribuida en el país. Mediante pruebas moleculares, COI, las poblaciones se separaron por origen geográfico sugiriendo una amplia variabilidad intraespecífica. Este estudio reporta las primeras secuencias de COI para P. araucensis en el mundo. Por otro lado, tres poblaciones fueron identificadas como R. similis, (dos de Caldas y una de Quindío) confirmándose la presencia de esta especie de nematodo en las zonas estudiadas. A partir de esta información, a futuro podrán plantearse eficientes programas de manejo integrado para las especies identificadas. (Texto tomado de la fuente)Phytoparasitic nematodes cause losses between 30 and 80% of plantain (Musa AAB Simmonds - Dominico Hartón) and banana (Musa acuminata) production in highly infested fields. In the areas of greater production in Colombia, their phytosanitary management has been limited by the wide ignorance of the nematode species present. In order to know the Pratylenchus and Radopholus species associated with plantain and banana crops in the departments of Valle del Cauca, Caldas and Quindío, samples composed of roots and rhizospheric soil from different production systems were collected. In the laboratory, the nematodes were extracted by the modified Cobb method and identified by morphological, morphometric (measurements of diagnostic characteristics) and molecular analysis (PCR amplification and sequencing of the D2-D3 segment of ribosomal RNA and Cytochrome oxidase I subunit [COI] of mitochondrial DNA for Pratylenchus and Internal Transcribed Spacer-ITS of ribosomal RNA for Radopholus). According to the results, five populations were identified as P. araucensis, two from Valle del Cauca, two from Quindío and one from Caldas, which indicates that this nematode species, previously reported in Arauca (Colombia), is widely distributed in the country. Using molecular data, but especially COI, populations were separated by geographic origin suggesting wide intraspecific variability. This study reports the first COI sequences for P. araucencis in the world. On the other hand, three populations (two from Caldas and one from Quindío) were identified as R. similis, confirming the presence of this nematode species in the studied areas. Based on this information, efficient integrated management programs for the identified species may be proposed in the future.MaestríaMagíster en Ciencias AgrariasEn el laboratorio de sanidad vegetal de la Universidad Nacional de Colombia, sede Palmira, los nematodos fueron extraídos por el método de Cobb modificado e identificados mediante análisis morfológico, morfométrico (mediciones de caracteres diagnósticos) y molecular (amplificación por PCR y secuenciación del segmento D2-D3 del ARN ribosomal y Citocromo oxidasa subunidad I [COI] del ADN mitocondrial para Pratylenchus e Internal Transcribed Spacer-ITS del ARN ribosomal para Radopholus).Protección de cultivo