Identification and tagging of genetic resistance factors to Sharka disease in apricot trees and Prunus davidiana

La sharka, maladie provoquée par le Plum Pox Virus (PPV), affecte gravement les arbres fruitiers à noyaux du genre Prunus. Le PPV est largement répandu en Europe de l’Est et dans les régions méditerranéennes. Il affecte, entre autre, fortement la qualité des fruits, les rendant impropres à la commercialisation. A ce jour, aucun cultivar de pêchers n’est résistant et la majorité des variétés cultivées d'abricotiers sont également sensibles. Cependant, des sources de résistance ont été identifiées chez Prunus davidiana, espèce apparentée au pêcher et chez quelques cultivars d’abricotiers. L’étude de la ségrégation de ce caractère dans des populations F1 et F2 a permis d’identifier plusieurs QTL chez chacune de ces espèces et de développer des marqueurs moléculaires utilisables en Sélection Assistée par Marqueurs. De plus, nous avons pu vérifier la robustesse de ces QTL dans différents fonds génétiques et la stabilité de la résistance selon l’inoculum et le type d’inoculations utilisés.The Plum pox virus (PPV), the causal agent of the sharka disease, is the most detrimental virus on stone-fruit trees, worldwide. Infected fruits are not marketable. To date, no stone fruit cultivar (peach, apricot, plum) is resistant. However, sources of resistance have been identified and mapped in apricot and Prunus davidiana, a wild peach-related species. Several of the mapped QTL co-localize with candidate genes previously identified. In the present study, resistance in P. davidiana was confirmed in an F2 population and two new QTL were identified. Quantitative analysis of the apricot cultivars ‘Goldrich’ and ‘SEO’ resistance was also performed. Molecular markers targeting these genes were developed as a tool for marker-assisted selection. This study made it also possible to refine boundaries of the genomic region controlling PPV resistance as well as confirming the robustness and stability of the resistance trait in both species: P. davidiana and P. armeniaca