Identifikasi Morfologi Dan Karakteristik Genetik Ikan Uceng (Nemacheilus Fasciatus) Berdasarkan Gen Cytochrome Oxidase C Subunit I (Coi)

Nemacheilus fasciatus merupakan ikan yang biasa hidup liar di beberapa aliran sungai di Jawa Timur. Ikan ini tergolong ke dalam genus Nemacheilus dan famili Nemacheilidae. Keberadaan ikan ini di perairan semakin menurun sehingga perlu dilakukan domestikasi. Proses domestikasi merupakan salah satu langkah penting dalam program pengembangan ikan liar menjadikan target budidaya. Untuk tujuan ini diperlukan informasi mengenai identifikasi spesies, karakter genetik dan analisis keragaman genetik sebagai plasma nutfah biodiversitas. Berdasarkan hal tersebut, penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi N. fasciatus di beberapa perairan sungai di Jawa Timur melalui karakter morfologi dan genetiknya. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies N. fasciatus di Jawa Timur berdasarkan karakter morfologi, berdasarkan gen cytochrome oxidase c subunit I (COI) dan menganalisis karakteristik genetik serta hubungan filogenetik N. fasciatus di Jawa Timur berdasarkan gen COI. Pengecekan spesies dan karakteristik genetika dilakukan dengan menggunakan DNA barcoding. DNA barcoding memberikan kecepatan dan keakuratan dalam identifikasi spesies dengan fokus analisis pada segmen kecil dari mtDNA, konfirmasi identitas sampel, melihat karakteristik genetik, pengecekan keragaman genetik dan kekerabatan, serta analisis filogenetik. DNA barcoding dalam penelitian menggunakan DNA mitokondria. COI sebagai barcode universal pada hewan dan secara global gen COI telah terpilih sebagai alat standar untuk taksonomi molekul dan identifikasi. Amplifikasi (PCR) gen COI dilakukan menggunakan kit GO TAQ Green PCR Mix dengan pasangan primer LCO1490 5‟-ggtcaacaaatcataaagatattgg3‟ dan HCO2198 5‟- taaacttcagggtgacca aaaaatca-3‟. Penelitian ini dilakukan pada bulan Maret sampai Mei 2019. Isolasi DNA, uji kualitatif dan kuantitatif DNA dan PCR dilakukan di Laboratorium Sentral Ilmu Hayati, Universitas Brawijaya, Malang.\ud Metode penelitian yang digunakan adalah metode deskriptif dengan pendekatan kuantitatif. Teknik pengumpulan data karakter morfologi dilakukan dengan teknik observasi dan pengukuran langsung di lokasi penelitian, sedangkan informasi genetik diperoleh melalui tahapan perlakuan di laboratorium. Hasil identifikasi sampel yang dikumpulkan berdasarkan karakter morfologi (morfometrik dan meristik) diketahui bahwa seluruh sampel merupakan spesies Nemacheilus fasciatus. Karakter meristik yang dapat digunakan sebagai penciri spesies ini antara lain pada kanan dan kiri tubuhnya terdapat pola totol (band) memanjang longitudinal diseluruh tubuh dati arah depan ke arah sirip ekor berjumlah 12-18 buah, bola mata berwarna hitam besar, lubang hidung dekat satu sama lain, memiliki sepasang barbel pada mulut dan memiliki pola menyerupai pelana pada dorsal berjumlah 11-12. Hasil analisis truss xi morphometric diketahui terdapat perbedaan pengaruh antara daerah terhadap panjang tertentu tubuh ikan. Variabel pengukuran yang menunjukkan perbedaan antara lain A1, A2, C2, C5 karena memiliki nilai P