Effect of photosensitizer molecule distance from DNA strand on light-induced damage

DNA nie absorbuje fal z zakresu światła widzialnego, ale uszkadzane jest pod jego wpływem. W procesie tym biorą udział inne cząsteczki pełniące rolę fotouczulaczy. Odległość cząsteczki DNA od fotouczulacza ma duże znaczenie. Zbadano tę zależność na układzie modelowym zakładając częstsze zderzenia fotouczulacza w wolnym roztworze niż tym przyłączonym do cząsteczki oligonukleotydu. Warianty układów modelowych naświetlano światłem widzialnym, a następnie użyto metody spektrometrii masowej by zobaczyć uszkodzenia cząsteczki oligonukleotydu, za pomocą zmian w uzyskanych widmach. W eksperymencie jako fotouczulaczy użyto barwnika fluorescencyjnego Cy3 oraz ryboflawiny. Wyniki wykonanych doświadczeń wskazują, iż oligonukleotyd nie jest uszkadzany pod wpływem światła, niezależnie od dystansu barwnika Cyanine3. W obecności ryboflawiny dochodzi do uszkodzenia oligonukleotydu.DNA damage is caused by visible light even though DNA does not absorb it. This process involves other molecules that act as photosensitizers. The distance between DNA molecule and photosensitizer is important. This distance was tested on a model assuming more frequent collisions of the photosensitizer in a free solution than that attached to the oligonucleotide molecule. Variants of models were treated with visible light, and then mass spectrometry was used to see damage to the oligonucleotide molecule. Damages could be seen by changes in the obtained spectra. The fluorescent dye Cyanine3 and riboflavin were used as photosensitizers in the experiment. The results of these experiments demonstrate that oligonucleotide is not damaged by light, regardless of the distance of the Cy3 dye. The oligonucleotide is damaged in the presence of riboflavin