Rendimiento diagnóstico de la prueba RT-PCR para dengue, zika y chikungunya en orina

Las enfermedades causadas por virus zika, dengue y chikungunya representan un problema de salud vigente para México. Los métodos diagnósticos basados en serología carecen de adecuado rendimiento, por lo que nuevos métodos diagnósticos necesitan ser estudiados y validados en distintos líquidos corporales. Material y Métodos: Se realizó una búsqueda de expedientes a quienes se haya realizado una prueba rt-PCR para DENV, ZIKV; CHKV en suero y orina del 1ero de septiembre del 2016 al 30 de septiembre del 2019. Se obtuvieron variables clínicas y demográficas de los expedientes de pacientes con cualquier resultado positivo. Se evaluó el rendimiento de la prueba rt-PCR en orina mediante cálculo de sensibilidad, especificidad y valores predictivos positivo y negativo. Resultados: Se realizaron un total de 976 pruebas rt-PCR en suero y orina. De estas, 331 (33.91%) resultaron positivas para cualquiera de los tres virus. De estas pruebas se excluyeron 124 expedientes incompletos, por lo que al final en la caracterización demográfica y análisis de variables clínicas se incluyeron un total de 207 expedientes (62.53%) de las pruebas positivas. Un total de 184 muestras fueron positivas para ZIKV. 52 de estas fueron positivas para solo en suero (28.2%), 76 (41.03%) solo en orina y hubo una correlación de detecciones de ARN en suero y orina en 56 muestras (30.43%). 792 muestras fueron negativas para ZIKV. Para virus DENV, 129 muestras fueron positivas. 94 (72.86%) solo en suero, 6 (4.65%) solo en orina y 29 (22.58%) mostraron correlación suero-orina. 846 muestras resultaron negativas para DENV. Las características clínicas de los pacientes con pruebas positivas se muestran en la tabla 1 para virus dengue, tabla 2 para virus zika y tabla 3 para chikungunya. Destaca que las pacientes con estado de embarazo fueron mayoría en las detecciones de cualquier de los virus. Las sensibilidad de la prueba en orina para ZIKV fue de 51.80%, especificidad de 91.20% con un valor predictivo positivo de 42.40% y valor predictivo negativo de 93.80%. Para DENV, la sensibilidad fue de 23.57%, especificidad de 99.20%, valor predictivo positivo de 82.85% y valor predictivo negativo de 90.0%. Para CHKV la sensibilidad fue de 28.50%, especificidad de 99.50%, valor predictivo positivo de 50% y valor predictivo negativo de 98.96%. Conclusiones: La realización de la prueba rt-PCR para ZIKV, DENV, CHKV en orina y suero incrementa la prevalencia del diagnóstico de arbovirus en la población estudiada. El mejor rendimiento diagnóstico se obtuvo al combinar rt-PCR en suero y orina, tomando en cuenta el alto valor predictivo negativo