Eucaryotic cells systems and their biotechnologycal applications

Predložená dizertačná práca je rozdelená na niekoľko častí. Prvá časť sa zaoberá interakciami proteínu p53 a jeho izoformami s rôznymi potenciálnymi DNA substrátmi za rôznych experimentálnych podmienok. Jedná sa prevažne o DNA a jej nekanonické štruktúrne motívy, ako sú G-kvadruplexy alebo krížové štruktúry, ktorých interakcie boli skúmané v izogénnych kvasinkových systémoch alebo technikami in vitro. Druhá časť práce sa zaoberá bioinformatickou analýzou spomínaných sekundárnych DNA štruktúr v rôznych skupinách organizmov, pričom výsledkom je súbor publikácií, ktoré vypovedajú o ich nenáhodnej distribúcii v genóme a ich vzťahu k regulácii. Posledná časť práce obsahuje doposiaľ nepublikované výsledky, vrátane výsledkov testovania vplyvu prírodných a syntetických látok na starnutie v modelových ľudských bunkách.The submitted dissertation is divided into several parts. The first part deals with the interactions of the p53 protein and its isoforms with different potential DNA substrates under different experimental conditions. These are predominantly DNA and its non-canonical structural motifs, such as G-quadruplexes or cruciform structures, whose interactions have been studied in yeast isogenic systems or by in vitro methods. The seconds part deals with the bioinformatic analysis of the mentioned secondary DNA structures in different organismal groups, and the result is a set of publications that show their non-random distribution in the genome and their relationship with regulation. The last part of the work contains unpublished results, including the results of testing the effect of natural and synthetic substances on aging in model human cells.