Molecular and phenotypic characterization of gram-negative bacteria resistant to carbapenems by KPC-type serine carbapenemases in a fourth-level institution in Bogotá, Colombia during the period 2018 to 2021

Introducción: La resistencia a carbapenémicos por bacterias gram negativas, supone una pérdida importante de medicamentos de ultima línea para su manejo. Adicionalmente, los métodos diagnósticos actuales para la identificación de estos mecanismos, no se encuentran ampliamente difundidos en las entidades hospitalarias. El conocimiento de la epidemiología local, permite orientar tratamientos anticipados, disminuyendo morbilidad y mortalidad asociada. Objetivos: Describir la distribución del gen KPC en bacterias gram negativas resistentes a carbapenémicos y su relación con las pruebas fenotípicas de identificación y diferenciación. Métodos: Se realizó un estudio observacional, descriptivo, de corte transversal. La población a estudio, estuvo conformada por las bacterias gram negativas, resistentes a carbapenémicos, con identificación del gen KPC, por panel molecular, en pacientes adultos que estuvieron hospitalizados, en la Fundación cardioinfantil durante los años 2018 a 2021. Resultados: se evaluaron 135 paneles moleculares sepsis, de los cuales, 41 detectaron el gen KPC. K. pneumoniae fue el germen principalmente encontrado de manera global (60.9%) y en cada uno de los servicios estudiados (UCI 68%, hospitalización 45.5% y urgencias 60%). Las pruebas fenotípicas, específicamente el test de hodge y ácido borónico, tuvieron una concordancia del 93.8% con la prueba molecular. Conclusiones: K. pneumoniae continua siendo el principal germen resistente a carbapenémicos por serin carbapenemasas tipo KPC.Introduction: Resistance to carbapenems by gram-negative bacteria represents a significant loss of last-line drugs for its management. In addition, the current diagnostic methods for the identification of these mechanisms are not widely used in hospital entities. The knowledge of the local epidemiology allows to guide anticipated treatments, reducing associated morbidity and mortality. Objectives: To describe the distribution of the KPC gene in gram-negative bacteria resistant to carbapenems and its relationship with phenotypic identification and differentiation tests. Methods: An observational, descriptive, cross-sectional study was carried out. The study population consisted of gram-negative bacteria, resistant to carbapenems, with identification of the KPC gene, by molecular panel, in adult patients who were hospitalized at the Fundación cardioinfantil during the years 2018 to 2021. Results: 135 sepsis molecular panels were evaluated, of which 41 detected the KPC gene. K. pneumoniae was the germ mainly found globally (60.9%) and in each of the services studied (ICU 68%, hospitalization 45.5% and emergency room 60%). The phenotypic tests, specifically the Hodge and boronic acid tests, had a 93.8% concordance with the molecular test. Conclusions: K. pneumoniae continues to be the main germ resistant to carbapenems due to KPC-type serine carbapenemases.2022-08-05 17:10:01: Script de automatizacion de embargos. Correo enviado 5ago2022: Hemos realizado la publicación de su documento: Caracterización molecular y fenotípica de bacterias gram negativas resistentes a carbapenemicos por serin carbapenemasas tipo KPC en una institución de cuarto nivel de Bogotá Colombia durante el periodo 2018 a 2021, el cual puede consultar en el siguiente enlace: https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/34666 Identificamos que ha marcado como restringido en el formulario, pero no realizo la notificación al correo edocur@urosario.edu.co, justificando la medida restrictiva al acceso del texto completo de su obra, frente a lo cual, el documento ha quedado embargado solo por un mes hasta el 5 de sep de 2022 en concordancia con las Políticas de Acceso Abierto de la Universidad. Si usted desea dejarlo con acceso abierto antes de finalizar dicho periodo o si por el contrario desea extender el embargo al finalizar este tiempo, puede enviar un correo a esta misma dirección realizando la solicitud. Tenga en cuenta que los documentos en acceso abierto propician una mayor visibilidad de su producción académica. De otra parte, si desea publicar su obra en una revista de prestigio, queremos invitarlo a tomar una asesoría con nuestros asesores de información del CRAI, quienes podrán brindarle orientación en la identificación de una revista adecuada para su obra y acompañamiento en la edición para publicación. La solicitud de asesoría puede agendarla en el siguiente link: https://n9.cl/agendamiento_servicios_crai2022-09-07 01:01:01: Script de automatizacion de embargos. info:eu-repo/date/embargoEnd/2022-09-0