La réalisation de systèmes embarqués exige aujourd'hui et encore plus demain la prise en compte de la problématique de la consommation électrique [10]. Actuellement, les outils de conception ne disposent que des estimateurs de consommation après synthèse. Nous proposons dans cet article une méthodologie basée sur des mesures permettant de modéliser des applications sur FPGA à partir de paramètres architecturaux et algoritmiques. Les applications ainsi modélisées peuvent être intégrées dans une base de données pour la conception système sous forme flot modulaire. Les modèles obtenus permettent alors au concepteur système de choisir au plus tôt la bonne adéquation algorithme/architecture respectant le budget en consommation de son application