Assessing the prevalence of citrus virus and virus-like diseases in Berkane area

Les phytovirus constituent un sujet de préoccupation majeur aussi bien au niveau mondial que national. L’efficacité des mesures de contrôle des phytovirus repose sur une bonne compréhension de leur étiologie et de leur épidémiologie. C’est dans ce contexte que la prévalence des viroses des agrumes, causées par des phytovirus et des microorganismes similaires aux virus, a été étudiée dans la région de Berkane. Un total de 277 échantillons a été prélevé dans 3 pépinières et 27 exploitations agrumicoles entre 2018 et 2019. Ces échantillons ont été testés contre des anticorps monoclonaux spécifiques pour citrus tristeza virus (CTV), citrus psorosis virus (CPsV), et Spiroplasma citri, moyennant Double Antibody Sandwich-Enzyme Linked-Immunosorbent Assay (DAS-ELISA). Seul CPsV a été détecté avec une prévalence de 18% (51/277). Nos résultats révèlent que les profils d’infection par CPsV sont significativement différents entre tous les sites prospectés et que ce virus est présent aussi bien sur oranger (24%) que sur clémentinier (15%). Des tests préliminaires de Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) ont permis de confirmer les résultats obtenus par DAS-ELISA pour CPsV et ont révélé également la présence de citrus exocortis viroid (CEVd) et hop stunt viroid (HSVd). Ces résultats contribueraient dans la formulation de pratiques viables de gestion des phytovirus et des microorganismes similaires aux virus dans la région de Berkane.Plant viruses represent serious threats to crop plants, particularly in intensive farming. They are responsible for tremendous losses in crop production and quality all over the world. The efficiency of their control relies on a good understanding of both their etiology and epidemiology. In this context, a survey of citrus virus and virus-like diseases was undertaken in the northeast of Morocco (Berkane area). 277 leaf samples were collected from citrus nurseries plants and orchards trees between 2018 and 2019 and were tested with Double-Antibody Sandwich-Enzyme Linked Immunosorbent Assay (DAS-ELISA) to detect citrus tristeza virus (CTV), citrus psorosis virus (CPsV), and Spiroplasma citri. Only CPsV was detected with an average prevalence of 18% (51/277). CPsV infection patterns were significantly different between all the surveyed orchards, and the virus was detected on both orange and clementine trees with an average prevalence of 24% and 15%, respectively. Preliminary Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) tests have confirmed the serological results obtained for CPsV and also allowed the detection of two viroids, citrus exocortis viroid (CEVd) and hop stunt viroid (HSVd). These results will help improve citrus virus and virus-like diseases control strategies in the Berkane area