Modelado molecular de la interacción entre la integrina αvβ3 y el pirrol polimerizado por plasma

El pirrol polimerizado por plasma (PPPy) es un polímero utilizado en aplicaciones biológicas, como en la regeneración de lesiones traumáticas de la médula espinal. Se ha propuesto que el PPPy puede interactuar con diversas proteínas de la matriz extracelular como la integrina αvβ3.En este trabajo, se analizó el reconocimiento molecular integrina-PPPy, mediante estudios de docking. Se utilizó un sistema combinatorio entre los grupos funcionales nitrilo (C≡N) y amino (NH₂) sobre la estructura del PPPy propuesta por Kumar et al., 2003, obteniendo seis diferentes combinaciones. En estos complejos, se observó que el Asp 227 generó un ambiente cargado negativamente para atraer al PPPy. Además se determinó la energía de unión (ΔGu) a estos complejos, donde las contribuciones electrostáticas fueron las más favorables. Esta información complementa los estudios in vivo desarrollados en este grupo de investigación, ya que en conjunto amplían el panorama a futuras investigaciones para el desarrollo de biomateriales.Plasma polymerized pyrrole (PPPy) is a polymer with biological applications, such as the regeneration of traumatic injuries of the spinal cord. It has been proposed that PPPy can interact with various extracellular matrix proteins such as integrin αvβ3. In this work, we performed a computational model for the interaction of the integrin αvβ3 with PPPy by docking analysis. A combinatorial system was used between nitrile (C≡N) and amino (NH₂) functional groups on the PPPy structure proposed by Kumar et al. (2003), obtaining six different combinations. In these complexes, it was observed that Asp 227 generated a negatively charged environment to attract PPPy. In addition, the binding energy (ΔGu) was determined for these complexes, where the electrostatic contributions were the most favorable. These results complement those obtained from in vivo assays, which together amplify the panorama for future research about for the development of materials with biomedical applications